骨髓增生異常綜合征中常見突變基因特征及其臨床關系.pdf

1、目的：對MDS患者骨髓或外周血標本進行目標區(qū)域測序，探討MDS中常見的突變基因特征及其與臨床的關系。
　　方法：通過參考相關文獻，選取8個在 MDS疾病中報道較多的、預后相對明確的、突變發(fā)生頻率較高的基因作為候選基因（candidate gene）。收集32例初診MDS病人的基因組DNA，將基因組DNA隨機打斷成長度為180–280bp的片段，采用Agilent公司的SuerSelect XT Kit試劑盒對目的基因片段進行文庫構

2、建和雜交捕獲，通過illumina HiSeq2500測序平臺進行PE125測序。
　　結果:
　　1、對32例MDS患者骨髓或外周血DNA進行8個候選基因測序結，發(fā)現(xiàn)其中有26例患者存在上述候選基因的突變，6例患者未發(fā)現(xiàn)上述候選基因突變，突變檢出率為（81.2％，26/32）。候選基因突變發(fā)生率，ASXL1：50%， TP53：40.6%，TET2：25%，RUNX121.9%，SF3B1：12.5%，EZH2：12.5%

3、， ETV6：0%，NRAS：0%。
　　2、不同亞型32例MDS患者結合突變情況發(fā)現(xiàn)，ASXL1、TP53、TET2、RUNX1和EZH2基因突變在RCMD、RAEB-I、RAEB-II較為常見，而SF3B1在RA和RARS亞型中常見。
　　3、32例MDS患者中有28例獲得核型分析結果，其中15正常核型中有12例患者存在基因突變，突變率為80%（12/15），13例異常核型患者中10患者存在基因突變,突變率為76.9%（

4、10/13），差異無統(tǒng)計學意義。
　　4、根據(jù)國際預后積分系統(tǒng)（IPSS）,將32例患者進行危險分層，其中低危組未納入病例，中危-1組13例患者，中危-2組11例患者，高危組8例患者。中危-1組患者中突變率為69.2%（9/13）；中危-2組患者突變率為91%(10/11)；高危組患者突變率為87.5%。
　　5、對32例患者進行隨訪，發(fā)現(xiàn)3例患者轉化為急性髓細胞白血病，平均轉白時間為10個月，3例患者均存在TP53突變其中

5、兩例合并復雜染色體核型。
　　6、32例患者中12例患者死亡（包括3例轉白后死亡患者），13例患者存活，7例患者失訪。12例患者死亡中3例為RCMD亞型，4例為RAEB-I亞型，5例為RAEB-II亞型，除1例患者未出現(xiàn)候選基因突變，其余死亡患者均存在候選基因突變情況。
　　結論:
　　（1）使用二代測序技術，對32例MDS患者進行目標基因靶向測序，發(fā)現(xiàn)因突變檢查率為81.3%（26/32），在核型正?；颊咧型蛔儥z出率

6、為80%(12/15)。
　?。?）基因突變普遍存在MDS患者中，基因突變在相對高危亞型（RAEBI/II）中發(fā)生率要高于相對低危亞型（RA/RARS）。
　?。?）IPSS危險分組越高，基因突變發(fā)生率越高，中危-2組和高危組患者的平均突變基因數(shù)高于中危-1組。
　?。?）ASXL1和TP53突變更多出現(xiàn)在IPSS中危-2和高危組患者，表現(xiàn)為白血病轉化風險高，預后差。
　　（5）二代測序技術能快速、準確檢測MDS