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1、實(shí)驗(yàn)?zāi)康模?br> 初步建立基于1HNMR技術(shù)和的UPLC-Q/TOF(液質(zhì)聯(lián)用)技術(shù)代謝組學(xué)方法,并將該方法應(yīng)用于乳腺癌患者血清中內(nèi)源性代謝物的變化,尋找乳腺癌相關(guān)診斷標(biāo)志物。在此基礎(chǔ)上初步比較了化療方案AC(阿霉素+環(huán)磷酰胺)干預(yù)前后乳腺癌患者血清中代謝物的變化,觀察化療方案干預(yù)后患者體內(nèi)血清中內(nèi)源性代謝物的變化趨勢(shì)。
研究方法:
1.研究對(duì)象的納入:選取體檢結(jié)果正常的11例健康人作為正常對(duì)照組;選
2、取符合納入標(biāo)準(zhǔn)的16例初診乳腺癌患者作為實(shí)驗(yàn)組。
2.標(biāo)本采集:采集11例正常女性靜脈血,分離并收集血清;分別采集實(shí)驗(yàn)組16例乳腺癌患者在化療前及化療一個(gè)療程后的靜脈血,分離并收集
3.建立基于1HNMR技術(shù)的血清代謝組學(xué)分析方法,包括實(shí)驗(yàn)方法和模式識(shí)別方法的選擇。并將建立的方法正常女性和實(shí)驗(yàn)組化療前血清的代謝組學(xué)分析,找出血清中代謝物的差異;同時(shí)將方法應(yīng)用于AC方案干預(yù)前后乳腺癌患者血清中的代謝物變化。通過(guò)
3、文獻(xiàn)檢索和數(shù)據(jù)查詢找出血清中差異。
4.建立基于液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)(UPLC-Q/TOF)技術(shù)的血清代謝組學(xué)分析平臺(tái),并將建立的方法正常女性和實(shí)驗(yàn)組化療前血清的代謝組學(xué)分析,找出差異;同時(shí)將方法應(yīng)用于AC方案干預(yù)前后乳腺癌患者血清中的代謝物變化。和1HNMR技術(shù)研究結(jié)果進(jìn)行比較。
5.?dāng)?shù)據(jù)分析:通過(guò)多種分析統(tǒng)計(jì)分析方法對(duì)產(chǎn)生的海量數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,分析過(guò)程包括:歸一化、修正80%規(guī)則、數(shù)據(jù)集分割和數(shù)據(jù)縮放等方法對(duì)數(shù)據(jù)集
4、進(jìn)行預(yù)處理;通過(guò)數(shù)據(jù)分析:采用主成分分析(principAlcomponentanalysis,PCA)、正交偏最小二乘判別分析(OrthogonalPartiAlLeast-Squares Discriminant Analysis,OPLS-DA)進(jìn)行模式識(shí)別分析;根據(jù)模型的變量重要性因子(VIP值)、非參數(shù)檢驗(yàn)結(jié)果和P值篩選潛在標(biāo)記物。
實(shí)驗(yàn)結(jié)果:
1.建立了1H-NMR的血清代謝組學(xué)方法,健康女性和乳
5、腺癌患者化療前、化療方案干預(yù)前后兩個(gè)組經(jīng)代謝組學(xué)方法得到很好的區(qū)分,并找到了相對(duì)應(yīng)的16個(gè)乳腺癌腫瘤標(biāo)志物。乳酸(lactate,1.33、4.12),纈氨酸(valine,0.99/1.04),N-乙酰糖蛋白(N-acetylgly-coproteins,2.04),谷氨酰胺(glutamine,2.41),磷酸膽堿/膽堿(phosphocholine/cholie,3.22),葡萄糖(a-glucose和B-glucose,3.40
6、-3.90,4.66,5.22),酪氨酸(tyrosine,6.87,7.17),組氨酸(histidine), LDL/VLDL,不飽和脂肪酸等峰有增大或減小的表現(xiàn)。
2.建立了UPLC-Q/TOF-MS的血清代謝組學(xué)研究方法,發(fā)現(xiàn)膽堿類和苯丙氨酸、異亮氨酸在正常人和乳腺癌患者化療前有不同,其中化療后的乳腺癌患者血清中的膽堿類有向正常變化單位趨勢(shì)。1HNMR技術(shù)所得到的標(biāo)記物和UPLC-Q/TOF得到的標(biāo)記物大部分不同,
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