聚酮合酶數(shù)據(jù)庫初步構(gòu)建及多烯類聚酮合酶系統(tǒng)發(fā)育分析.pdf

1、本文初步構(gòu)建了聚酮類抗生素生物合成基因簇?cái)?shù)據(jù)庫，相比已有的兩個(gè)聚酮合酶數(shù)據(jù)庫，內(nèi)容方面重點(diǎn)增加了聚酮合酶后修飾酶（主要包括糖基轉(zhuǎn)移酶，糖基合成酶，甲基轉(zhuǎn)移酶等）部分；功能方面，新建的數(shù)據(jù)庫將具有更強(qiáng)的實(shí)用性，尤其是給系統(tǒng)發(fā)育分析研究帶來了更多的方便，可以輕松的實(shí)現(xiàn)多序列下載、比對(duì)功能，還可以查閱相關(guān)的參考文獻(xiàn)等，為組合生物合成新的聚酮類抗生素提供了一個(gè)良好的平臺(tái)。 多烯大環(huán)內(nèi)酯類抗生素是一類重要的抗真菌藥物，具有相似的化學(xué)結(jié)構(gòu)，

2、生物合成基因簇也有很近的親緣關(guān)系，因此本文選擇多烯大環(huán)內(nèi)酯類聚酮合酶作為研究對(duì)象，分別采用貝葉斯法、鄰接法以及最大簡約法三種建樹方法，重點(diǎn)對(duì)酮基合成酶（ketosynthase，KS），?；D(zhuǎn)移酶（acyltransferase，AT），酮基還原酶（ketoreductase，KR），脫水酶（dehydratase，DH）等結(jié)構(gòu)域進(jìn)行了系統(tǒng)發(fā)育分析。結(jié)果顯示多烯大環(huán)內(nèi)酯類抗生素不同結(jié)構(gòu)部分對(duì)應(yīng)的聚酮合酶具有不同的進(jìn)化方式，而且有趣的是進(jìn)

3、化方式與該部分結(jié)構(gòu)的功能以及化學(xué)結(jié)構(gòu)的保守性相關(guān)。一方面，對(duì)抗生素活性以及選擇性毒性有重要影響的化學(xué)結(jié)構(gòu)部分，具有功能方面的保守性；對(duì)應(yīng)的聚酮合酶來自一共同的祖先，具有序列上的保守性；這部分化學(xué)結(jié)構(gòu)主要包括糖基化位點(diǎn)、羧基化位點(diǎn)以及半酮縮醇部分，具有結(jié)構(gòu)方面的保守性。另一方面，多烯部分對(duì)應(yīng)的聚酮合酶的主要進(jìn)化方式為基因內(nèi)部復(fù)制，復(fù)制數(shù)量的不同導(dǎo)致生成不同種類的，具有不同抗真菌活性的多烯大環(huán)內(nèi)酯類抗生素。除此之外，我們也對(duì)多烯類抗生素存在