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1、目的:(1)應(yīng)用分子生物學(xué)技術(shù),從人正常肝細(xì)胞中擴(kuò)增出hSOD1cDNA。(2)采用基因克隆技術(shù),構(gòu)建pGBKT7-hSOD1cDNA重組質(zhì)粒;(3)通過(guò)對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果,進(jìn)行雙酶切凝膠電泳和測(cè)序驗(yàn)證,對(duì)測(cè)序報(bào)告結(jié)果中hSOD1基因序列進(jìn)行序列與結(jié)構(gòu)相關(guān)的生物信息學(xué)分析,為認(rèn)識(shí)該基因結(jié)構(gòu)與功能提供借鑒。
方法:(1)目的基因的提?。簭娜苏8渭?xì)胞中提取總RNA,然后對(duì)其進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生第一條cDNA鏈。根據(jù)GeneBank中人Cu/Z
2、n-SODcDNA序列(序列號(hào):AB087266)設(shè)計(jì)一對(duì)PCR引物,對(duì)反轉(zhuǎn)錄后產(chǎn)生的第一條cDNA鏈進(jìn)行PCR擴(kuò)增,獲得目的基因。(2)穿梭質(zhì)粒的構(gòu)建與鑒定:①?gòu)?fù)蘇本實(shí)驗(yàn)室保存的含穿梭質(zhì)粒pGBKT7的DH5ɑ菌種,用質(zhì)粒抽提試劑盒抽取質(zhì)粒pGBKT7;②用EcoRⅠ、SalⅠ雙酶切質(zhì)粒pGBKT7,獲得線性化的pGBKT7片段,在T4DNA連接酶的作用下與目的基因連接,構(gòu)建重組質(zhì)粒pGBKT7-hSOD1cDNA;③對(duì)重組質(zhì)粒pGB
3、KT7-hSOD1cDNA進(jìn)行酶切鑒定;④將重組質(zhì)粒送測(cè)序公司進(jìn)行DNA序列分析。(3)hSOD1cDNA基因的生物信息分析:根據(jù)測(cè)序報(bào)告結(jié)果中hSOD1基因序列,用生物信息學(xué)方法對(duì)其進(jìn)行同源性、分子量等項(xiàng)的分析和預(yù)測(cè)。
結(jié)果:(1)利用分子生物學(xué)技術(shù),成功擴(kuò)增出目的hSOD1cDNA基因。(2)重組質(zhì)粒pGBKT7-hSOD1cDNA經(jīng)過(guò)EcoRⅠ、SalⅠ雙酶切后,進(jìn)一步將重組體進(jìn)行基因測(cè)序分析,驗(yàn)證了克隆的hSOD1cD
4、NA序列與GeneBank中(AB087266)公布的hSOD1序列相符合。這一結(jié)果表明重組體pGBKT7-hSOD1cDNA中插入的目的基因是正向的、單倍插入。(3)hSOD1生物信息分析結(jié)果顯示,hSOD1全長(zhǎng)459bp,編碼153個(gè)氨基酸,經(jīng)過(guò)GeneBank查詢發(fā)現(xiàn)與人SOD1基因序列有99%同源性。
結(jié)論:(1)成功構(gòu)建了重組質(zhì)粒pGBKT7-hSOD1cDNA,為深入研究hSOD1功能及與它相互作用蛋白的蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò)
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