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文檔簡介
1、目的:分析MDS患者血清蛋白質(zhì)指紋圖譜,旨在尋找MDS血清中顯著表達(dá)差異的血清標(biāo)志物,建立診斷MDS的血清標(biāo)志物決策樹分析模型。以及試著尋找MDS各類型之間存在著表達(dá)差異蛋白,建立鑒別MDS各類型的人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型(artifical neyral network,ANN)。 方法:應(yīng)用美國Ciphergen公司生產(chǎn)的PBSⅡ-時間飛行質(zhì)譜儀和蛋白芯片作為蛋白組學(xué)研究平臺,對21例MDS患者(其中RA 6例、RAEB 6例、RA
2、EBt 2例、CMML 7例)、6例急性髓性白血病和12例健康對照組的血清蛋白質(zhì)質(zhì)譜進(jìn)行測定分析,建立相關(guān)的蛋白質(zhì)組學(xué)飛行質(zhì)譜資料庫,獲得的結(jié)果采用Ciphergen公司的Biomarker Wizard軟件以及BPS5.0(Biomarker patterns systems)軟件進(jìn)行分析。 結(jié)果:在分子量0-50000Da范圍內(nèi),兩例BEABt標(biāo)本除外,其它標(biāo)本均能檢測到362個左右的蛋白質(zhì)譜峰。與健康組比較MDS患者組中共
3、檢測出9個蛋白峰差異表達(dá)有顯著意義(P<0.01),其中5個蛋白峰相對分子量M/Z(mass/charge)分別為2738Da、2949Da、 3157Da、3239Da、3397Da在MDS患者血清高表達(dá),4個蛋白峰(M/Z分別為6441Da、6640Da、 8160Da、8957Da)在MDS患者血清中低表達(dá)。依據(jù)差異蛋白峰分類權(quán)重篩選出2個顯著差異性蛋白峰,相對分子量M/Z分別為2738Da,6441Da建立判斷MDS的決策樹分析
4、模型,其判斷MDS的預(yù)期敏感性100%,預(yù)期特異性100%。同時發(fā)現(xiàn)MDS不同類型之間也存在差異蛋白,MDS各類型與健康對照組、急性髓白血病患者之間篩選出22個差異表達(dá)蛋白(P<0.05),有分類價值的14種,并用它們建立了初步鑒別MDS類型的人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型。 結(jié)論:SELDI-TOF-MS結(jié)合蛋白質(zhì)芯片技術(shù)能夠快速、有效地篩選出MDS血清中特異表達(dá)標(biāo)志物,用特異表達(dá)標(biāo)志物建立的判斷模型能用來診斷MDS以及初步鑒別各個類型的M
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