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文檔簡介
1、目的:建立蛋白質(zhì)芯片技術(shù)檢測血清蛋白質(zhì)指紋圖譜的方法,探討基于人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的血清蛋白質(zhì)指紋圖譜模型在肝癌及肝硬化鑒別診斷中的應(yīng)用價值?! 》椒ǎ?4例血清標本,其中52例肝癌和22例肝硬化患者的血清標本均來自浙江大學醫(yī)學院附屬第二醫(yī)院腫瘤科。52例肝癌均經(jīng)術(shù)后病理報告確定,男性32例,女性20例,平均年齡60.6歲(39~81歲)。22例肝硬化與肝癌年齡和性別配對。所有的血清標本均在清晨空腹下抽取,分離血清后儲存于-80℃低溫冰箱中。
2、肝癌的血清標本均在進行治療前留取。研究方法用表面增強激光解析離子化飛行時間質(zhì)譜技術(shù)(SELDI-TOF-MS),對肝癌患者及肝硬化患者血清蛋白質(zhì)進行分析對比。并隨機將74例標本分為兩組:訓練組(49)與測試組(25),首先對49例標本進行人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)訓練,得到一個模型,并對該模型進行檢驗。再對25例未知的血清標本(包括肝癌患者,肝硬化患者)進行盲法預(yù)測,應(yīng)用相同的技術(shù)路線與收集數(shù)據(jù)的方法,用已確定的聚類方法對25例血清的蛋白質(zhì)的質(zhì)譜進行
3、聚類,同樣得到與訓練組相同的質(zhì)荷比的峰值,將數(shù)據(jù)導出后,進行矩陣轉(zhuǎn)換,再導入已建立的人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型,輸出預(yù)測值。數(shù)據(jù)處理:所有原始數(shù)據(jù)先用ProteinchipSoftware3.1做校正:(總離子強度及質(zhì)荷比的均一化)。將所有樣本2km/z以上的質(zhì)荷比峰,用ProteinchipSoftware3.0的biomarkwizard過濾噪音,設(shè)置初始的噪音過濾值為5,第二次的噪音過濾值為2,以10%為最小閾值進行聚類。對肝硬化與肝癌的血
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