基于人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)肝癌血清蛋白質(zhì)指紋圖譜模型的建立及其應(yīng)用研究.pdf

1、目的：建立蛋白質(zhì)芯片技術(shù)檢測(cè)血清蛋白質(zhì)指紋圖譜的方法，探討基于人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的血清蛋白質(zhì)指紋圖譜模型在肝癌及肝硬化鑒別診斷中的應(yīng)用價(jià)值。　　方法：74例血清標(biāo)本，其中52例肝癌和22例肝硬化患者的血清標(biāo)本均來(lái)自浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬第二醫(yī)院腫瘤科。52例肝癌均經(jīng)術(shù)后病理報(bào)告確定，男性32例，女性20例，平均年齡60.6歲(39～81歲)。22例肝硬化與肝癌年齡和性別配對(duì)。所有的血清標(biāo)本均在清晨空腹下抽取，分離血清后儲(chǔ)存于-80℃低溫冰箱中。

2、肝癌的血清標(biāo)本均在進(jìn)行治療前留取。研究方法用表面增強(qiáng)激光解析離子化飛行時(shí)間質(zhì)譜技術(shù)(SELDI-TOF-MS)，對(duì)肝癌患者及肝硬化患者血清蛋白質(zhì)進(jìn)行分析對(duì)比。并隨機(jī)將74例標(biāo)本分為兩組：訓(xùn)練組(49)與測(cè)試組(25)，首先對(duì)49例標(biāo)本進(jìn)行人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)訓(xùn)練，得到一個(gè)模型，并對(duì)該模型進(jìn)行檢驗(yàn)。再對(duì)25例未知的血清標(biāo)本(包括肝癌患者，肝硬化患者)進(jìn)行盲法預(yù)測(cè)，應(yīng)用相同的技術(shù)路線與收集數(shù)據(jù)的方法，用已確定的聚類方法對(duì)25例血清的蛋白質(zhì)的質(zhì)譜進(jìn)行

3、聚類，同樣得到與訓(xùn)練組相同的質(zhì)荷比的峰值，將數(shù)據(jù)導(dǎo)出后，進(jìn)行矩陣轉(zhuǎn)換，再導(dǎo)入已建立的人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型，輸出預(yù)測(cè)值。數(shù)據(jù)處理：所有原始數(shù)據(jù)先用ProteinchipSoftware3.1做校正：(總離子強(qiáng)度及質(zhì)荷比的均一化)。將所有樣本2km/z以上的質(zhì)荷比峰，用ProteinchipSoftware3.0的biomarkwizard過(guò)濾噪音，設(shè)置初始的噪音過(guò)濾值為5，第二次的噪音過(guò)濾值為2，以10％為最小閾值進(jìn)行聚類。對(duì)肝硬化與肝癌的血