應(yīng)用SELDI-TOF質(zhì)譜技術(shù)篩選直腸癌病人血清中特異性生物標(biāo)志物.pdf

1、目的: 運(yùn)用SEIDI-TOF(surfaced enhanced laser desorption/ionization-time of flight)質(zhì)譜技術(shù)和生物信息學(xué)方法，尋找與直腸癌相關(guān)的特征性血清蛋白標(biāo)志物質(zhì)譜分析圖譜變化。 方法: 應(yīng)用美國Ciphergen公司的PBS Ⅱ C蛋白質(zhì)芯片.時間飛行質(zhì)譜儀作為蛋白質(zhì)組學(xué)研究平臺，研究98例直腸癌患者、40例對照組血清樣本的蛋白質(zhì)質(zhì)譜變化，同時進(jìn)行比較，建立相關(guān)的蛋白質(zhì)

2、組學(xué)飛行質(zhì)譜資料庫，獲得的結(jié)果采用Ciphergen公司的Biomarker Wizard軟件BPS 5.0Biomarker Pmtemssystemsl軟件進(jìn)行分析，尋找直腸癌病人、對照組的蛋白質(zhì)譜差異，并建立分類樹模型。 結(jié)果: 直腸癌病人與對照組有26個蛋白質(zhì)含量存在統(tǒng)計學(xué)顯著差異(P<0.05)。與對照組血清蛋白質(zhì)譜相比，直腸癌病人血清中有12個標(biāo)志分子高表達(dá)，14個標(biāo)志分子低表達(dá)。采用Biomarker Patter

3、n軟件對來源于BiomarkerWizard的數(shù)據(jù)進(jìn)行處理，在設(shè)定條件下9295、3700、3938和4095 Da四個標(biāo)志蛋白被系統(tǒng)自動選取用以建立分類樹模型，用此模型對138例樣本進(jìn)行劃分，結(jié)果顯示：98例直腸癌病人有2例被漏診，40例非直腸癌標(biāo)本有2例被錯劃為癌癥。此診斷模型診斷敏感性97.96％，特異性95％。經(jīng)盲法驗證，其敏感性為95.0％(57/60)，特異性為93.4％(45/48)，遠(yuǎn)高于傳統(tǒng)腫瘤標(biāo)志物CEA(敏感性68