

版權(quán)說(shuō)明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權(quán),請(qǐng)進(jìn)行舉報(bào)或認(rèn)領(lǐng)
文檔簡(jiǎn)介
1、芯片及測(cè)序技術(shù)的發(fā)展大大促進(jìn)了癌癥在分子層次上的研究。多組學(xué)及技術(shù)平臺(tái)的聯(lián)合應(yīng)用提供了更多的限制條件,減少了假陽(yáng)性。本文整合了包括來(lái)自測(cè)序及芯片平臺(tái)的2組表觀遺傳學(xué)數(shù)據(jù),3組DNA與蛋白質(zhì)相互作用數(shù)據(jù)(ChIP-Seq),10組基因表達(dá)數(shù)據(jù)以及4組microRNA表達(dá)數(shù)據(jù)共計(jì)四類組學(xué)數(shù)據(jù),對(duì)前列腺癌涉及的重要調(diào)控網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行了一個(gè)綜合性的整合分析。首先對(duì)這四類組學(xué)數(shù)據(jù)在基因和通路層次上的的兩兩配對(duì)分析,驗(yàn)證了不同數(shù)據(jù)集系統(tǒng)水平上的分子特征相
2、似性要高于基因水平的相似性這一假設(shè)。另外對(duì)四類組學(xué)數(shù)據(jù)的 KEGG富集通路分析發(fā)現(xiàn)在所有的數(shù)據(jù)集中都存在ECM-receptor interaction及Pathways in cancer通路的富集。對(duì)這四類組學(xué)數(shù)據(jù)的GeneGo富集通路分析發(fā)現(xiàn)了130條在四類組學(xué)數(shù)據(jù)中都存在的調(diào)控通路。值得一提的是,KEGG和GeneGo的富集通路中都有與ECM相關(guān)的通路。同時(shí)我們還發(fā)現(xiàn)了一些前列腺癌相關(guān)的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)新通路,如TGF, WNT and
3、 cytoskeletal remodeling。
在多組學(xué)數(shù)據(jù)整合分析的前提下,我們還對(duì)ChIP-Seq富集位點(diǎn)查找(peak calling)算法軟件做了深入的研究。我們搜集整理了近幾年內(nèi)發(fā)表的50個(gè)peak calling算法軟件,并選取當(dāng)前較流行的9個(gè)軟件,并搜集了三種類型共10組ChIP-Seq數(shù)據(jù)對(duì)它們?cè)诓檎业母患鍞?shù),靈敏度,一致性和精確性等方面做了一個(gè)評(píng)價(jià)比較,并且在此基礎(chǔ)上我們把這些評(píng)比的peak calli
溫馨提示
- 1. 本站所有資源如無(wú)特殊說(shuō)明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請(qǐng)下載最新的WinRAR軟件解壓。
- 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請(qǐng)聯(lián)系上傳者。文件的所有權(quán)益歸上傳用戶所有。
- 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁(yè)內(nèi)容里面會(huì)有圖紙預(yù)覽,若沒有圖紙預(yù)覽就沒有圖紙。
- 4. 未經(jīng)權(quán)益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
- 5. 眾賞文庫(kù)僅提供信息存儲(chǔ)空間,僅對(duì)用戶上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護(hù)處理,對(duì)用戶上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯,并不能對(duì)任何下載內(nèi)容負(fù)責(zé)。
- 6. 下載文件中如有侵權(quán)或不適當(dāng)內(nèi)容,請(qǐng)與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
- 7. 本站不保證下載資源的準(zhǔn)確性、安全性和完整性, 同時(shí)也不承擔(dān)用戶因使用這些下載資源對(duì)自己和他人造成任何形式的傷害或損失。
最新文檔
- 基于癌癥異質(zhì)性尋找前列腺癌相關(guān)新型miRNA調(diào)控的生物通路.pdf
- 前列腺癌去勢(shì)抵抗轉(zhuǎn)化相關(guān)miRNA及其調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的整合分析.pdf
- 基于系統(tǒng)生物學(xué)的前列腺癌生物靶點(diǎn)的整合分析.pdf
- 前列腺癌骨轉(zhuǎn)移的相關(guān)因素分析.pdf
- 前列腺癌相關(guān)基因PC-1功能研究及其調(diào)控通路初探.pdf
- 前列腺癌的護(hù)理
- 前列腺癌的診斷
- 前列腺癌中多重信號(hào)通路的表達(dá)檢測(cè).pdf
- 前列腺癌中信號(hào)通路的作用機(jī)制研究.pdf
- 基于SAGE數(shù)據(jù)庫(kù)挖掘技術(shù)篩選分析前列腺癌相關(guān)新基因.pdf
- 基于RNA-seq的前列腺癌lncRNA相關(guān)的分析研究.pdf
- 前列腺癌演示
- 前列腺癌護(hù)理
- 010前列腺癌
- 前列腺癌雄激素轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的研究.pdf
- 前列腺癌解讀
- 前列腺癌課件
- 前列腺癌的mr診斷
- 前列腺癌檢測(cè)的比較影像學(xué)研究.pdf
- 前列腺癌中Hedgehog信號(hào)通路的表達(dá)及意義.pdf
評(píng)論
0/150
提交評(píng)論