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文檔簡介
1、目的:
本研究以第10號染色體同源丟失性磷酸酶-張力蛋白基因(phosphatase andtensin homology deleted on cnhromosome10,PTEN)為候選基因,篩查分析江西地區(qū)HBV相關肝癌患者,探討PTEN基因是否與HBV相關肝癌發(fā)病有關及同其臨床表型的關系。
方法:
收集60例HBV相關肝癌患者(Hepatocellular carcinoma,HCC組)
2、、70例慢性乙型病毒性肝炎患者(Chronic Viral Hepatitis B,CH-B組)、135例正常對照(Control,C組)外周血標本,通過候選基因和DNA直接測序法,對PTEN基因外顯子和內含子區(qū)進行DNA測序篩查,尋找基因突變及多態(tài)性并進行肝癌關聯分析。Hardy-Weinberg平衡檢驗、各組間基因型、等位基因及單體型頻率比較采用x2或Fisher精確概率法計算;相對風險度計算采用非條件logistic回歸分析。
3、r> 結果:
HCC組患者PTEN基因未發(fā)現突變,但在其DNA序列上發(fā)現4個多態(tài)性,即Ala34Cys、leu57phe、IVS8+G32T和T2281G。隨后我們選取常見的基因多態(tài)性(頻率>5%)并可能影響其表達的Ala34Cys和IVS8+G32T位點進行研究?;蚍中惋@示,Ala34Cys多態(tài)性只檢測到GC/GC和GC/TG兩種基因型,未發(fā)現TG/TG基因型;IVS8+G32T則存在G/G、G/T、T/T三種基
4、因型。兩位點各基因型頻率及等位基因頻率分布在HCC組、CH-B組及正常對照組之間均無統(tǒng)計學差異。對Ala34Cys和IVS8+G32T進行單體型構建發(fā)現存在GCG、GCT、TGT、TGG等4種單體型,x2檢驗發(fā)現HCC組同正常對照組相比,GCG單體型分布存在顯著差異(x2=4.78,P=0.03),logistic回歸分析顯示GCG單體型攜帶者較非GCG單體型攜帶者發(fā)生肝癌的風險明顯減小(OR=0.62,95%CI為0.40-0.95)
5、,其余3種單體型未發(fā)現顯著差異。分析發(fā)現各基因型、等位基因及單體型分布頻率同HBV相關肝癌臨床病理指標包括血清甲胎蛋白(AFP)、合并肝硬化、腫瘤病理分級、數目、大小、TNM分期以及轉移等無顯著差異,但對基因型分布頻率比較發(fā)現攜帶Ala34Cys GC/GC基因型和IVS8+G32T T等位基因者較GC/TG和G等位基因者在AFP≥400 ug/L(分別為70.2%vs29.8%和55.3%vs44.7%)、合并肝硬化(分別為77.8%
6、vs22.2%和55.6%vs44.4%)、中低分化(分別為78.6%vs21.4%和60.7%vs39.3%)、腫瘤直徑≥5cm(分別為71.8%vs28.2%和57.7%vs42.3%)、多發(fā)(分別為79.2%vs20.8%和61.4%vs38.6%)、TNM分期Ⅲ+Ⅳ(分別為70.0%vs30.0%和60.0%vs40.0%)及轉移(分別為82.4%vs17.6%和55.8%vs44.2%)中所占比例較高。
結論:<
7、br> 1.在PTEN基因中發(fā)現Ala34Cys、leu57phe、IVS8+G32T和T2281G等4個多態(tài)性,其中Ala34Cys、leu57phe和T2281G為首次發(fā)現。
2.PTEN基因Ala34Cys和IVS8+G32T多態(tài)性在江西人群HBV相關肝細胞肝癌發(fā)生過程中可能存在交互效應,攜帶GCG單體型對于HBV相關肝癌發(fā)生具有保護作用。
3.PTEN基因突變與江西地區(qū)HBV相關肝細胞肝癌可能無
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