致病疫霉中致病相關(guān)miRNA的挖掘及功能分析.pdf

1、microRNA(miRNA)是一類長(zhǎng)約22nt的非編碼小RNA分子，參與真核生物的生長(zhǎng)發(fā)育和脅迫響應(yīng)等過程。近年來，越來越多的研究表明，miRNA在病原物與植物互作過程中起著重要的調(diào)節(jié)作用。致病疫霉（Phytophthora infestans）可侵染番茄和馬鈴薯，造成嚴(yán)重的晚疫病，該病發(fā)生面廣，影響甚大。但是，致病疫霉中miRNA的研究甚少，更沒有與致病相關(guān)miRNA的挖掘報(bào)道?；谏鲜鰻顩r，本研究利用生物信息學(xué)方法，系統(tǒng)地預(yù)測(cè)了致

2、病疫霉中致病相關(guān)的miRNA，并通過生物學(xué)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證了它們的功能。
　　首先，借助計(jì)算機(jī)數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)，共計(jì)預(yù)測(cè)到128個(gè)致病相關(guān)的miRNA，它們隸屬于66個(gè)miRNA家族。通過致病相關(guān)miRNA關(guān)系網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建，初步篩選到能形成網(wǎng)絡(luò)的33個(gè)miRNA家族。分別挑選位于網(wǎng)絡(luò)核心和邊緣的各2個(gè)miRNA進(jìn)行檢測(cè)，順利地驗(yàn)證到了pi-miR466和pi-miR1918。
　　其次，通過實(shí)時(shí)定量分析pi-miR466和pi-miR19