浙東白鵝和朗德鵝MC1R基因變異與定量表達研究.pdf

1、毛色/羽色是一種可利用的經(jīng)濟性狀和遺傳標記，它在確定品種純度、雜交組合和親緣關系方面具有重要作用。黑素皮質素受體1（Melanocortin1 Receptor, MC1R）基因變異與許多脊椎動物（包括一些鳥類）的毛色/羽色表型相關，是毛色/羽色遺傳的重要候選基因。本研究以MC1R基因為研究對象，采用PCR產物直接測序的方法，對朗德鵝灰羽和花羽（灰白相間）、浙東白鵝白羽3個羽色系MC1R基因的部分編碼區(qū)進行了單核苷酸多態(tài)性（Single

2、NucleotidePolymorphism,SNP）篩查和遺傳多樣性分析，并通過熒光定量PCR技術，分析MC1R基因在1d、14d、21d、28d、42d和56d六個時間點品種間的表達差異和在皮膚組織中不同時間點的發(fā)育性變化，以探討MC1R基因變異對浙東白鵝和朗德鵝羽色遺傳的影響，從而為遺傳育種研究提供分子生物學依據(jù)。
　　 本試驗擴增了浙東白鵝和朗德鵝MC1R基因編碼區(qū)的714bp。通過生物信息學分析，發(fā)現(xiàn)A+T含量為40.

3、20％，G+C含量為59.52％，A+T含量遠低于G+C含量。浙東白鵝與朗德鵝MC1R基因與GenBank中其它雁屬MC1R基因的核苷酸同源性高達99％以上。
　　 通過對SNP位點的篩選，在所有群體中共篩查到5個SNPs，即210C＞T、321C＞T、411C＞T、525C＞T、756G＞A，且都為簡約信息位點。其中210C＞T、321C＞T、756G＞A3個突變位點只存在于浙東白鵝中，411C＞T、525C＞T2個突變位點只

4、存在于朗德鵝中，經(jīng)過與GenBank中已提交的鵝的MC1R基因序列比對，發(fā)現(xiàn)這5個SNPs都是在浙東白鵝和朗德鵝中新發(fā)現(xiàn)的SNPs。將核苷酸序列翻譯后發(fā)現(xiàn)，這5個突變位點并未引起氨基酸序列的改變，均為同義突變。用Phase軟件進行分型，共分出7種單倍型，其中單倍型Z2(C-C-C-C-G)和Z4(C-C-T-C-G)為優(yōu)勢單倍型，Z2Z2和Z4Z4單倍型組合為優(yōu)勢單倍型組合。經(jīng)卡方獨立性檢驗，這5個突變位點不同基因型和單倍型在鵝品種間和

5、羽色性狀間的分布差異都達到了極顯著水平的水平，表明MC1R基因對鵝的羽色性狀有著重要影響，說明MC1R基因是鵝羽色的主要候選基因。
　　 本研究采用熒光定量PCR技術檢測了MC1R基因mRNA水平表達情況，結果表明，MC1R基因在浙東白鵝1d皮膚組織中的表達量最高，而在朗德鵝中卻是在28d皮膚組織中表達量最高。對于同一時間點，除1d和21d外，其余時間點浙東白鵝和朗德鵝品種間的表達差異均達到了顯著或極顯著的水平。對于同一品種不同