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文檔簡(jiǎn)介
1、本試驗(yàn)以番鴨、高郵鴨和櫻桃谷鴨(即英系北京鴨)為研究對(duì)象,研究了非傷害性和傷害性毛囊組織取樣法對(duì)總RNA提取質(zhì)量的影響,從而為禽類毛囊組織分子生物學(xué)的深入研究提供一種新的技術(shù)方法。在此基礎(chǔ)上,克隆了鴨羽色相關(guān)基因刺鼠信號(hào)蛋白(Agouti signaling protein,ASIP)和刺鼠相關(guān)蛋白(Agouti-relatedprotein,AGRP)基因的部分序列,同時(shí)采用半定量RT-PCR的方法研究了ASIP和AGRP基因在番鴨各
2、組織中的表達(dá)規(guī)律。研究結(jié)果如下:
⑴以番鴨、高郵鴨和英系北京鴨非傷害性取樣法獲得的毛囊組織RNA為模板,用反轉(zhuǎn)錄—聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(RT-PCR)方法擴(kuò)增了含有Agouti信號(hào)蛋白(ASIP)基因的CDS片段,將其克隆測(cè)序,獲得長(zhǎng)為308bp的編碼序列。結(jié)果表明,高郵鴨和英系北京鴨所得的部分ASIP基因的CDS序列完全一致,同源性為100%。與GenBank上登陸的原雞及鵪鶉的ASIP對(duì)應(yīng)的CDS序列進(jìn)行比對(duì),番鴨、高郵鴨和
3、英系北京鴨的同源性均在92.53%以上。番鴨、高郵鴨和英系北京鴨ASIP基因的CDS片段編碼102個(gè)氨基酸,與原雞和鵪鶉對(duì)應(yīng)的氨基酸序列比對(duì)同源性均高于92.16%,由此可見(jiàn)禽類的ASIP基因具有高度的保守性,同時(shí)也證明了毛囊非傷害性取樣的可行性,為禽類毛囊取樣的方法提供了一種新的參考。所得序列均已傳至GenBank,基因登錄號(hào)分別為HM059823和HM059824。
⑵根據(jù)雞、鵪鶉、綠頭野鴨等AGRP基因同源序列的保守
4、區(qū)設(shè)計(jì)引物,用PCR擴(kuò)增番鴨,高郵鴨和英系北京鴨基因組DNA,回收目的片段,然后克隆測(cè)序。番鴨、高郵鴨和英系北京鴨分別擴(kuò)增出1213bp、1195bp和1196bp的核苷酸序列,包括2個(gè)內(nèi)含子、外顯子2、部分外顯子1和部分外顯子3。序列比對(duì)發(fā)現(xiàn)鴨與其他雞形目禽種相比,AGRP基因編碼序列和氨基酸序列同源性較高,但在內(nèi)含子2上變異較大,鴨與雞形目物種相比,內(nèi)含子2少200bp左右。序列經(jīng)上傳所得基因登錄號(hào)分別為HM059820、HM059
5、821和HM059822。
⑶利用半定量RT-pCR方法檢測(cè)了ASIP基因和AGRP基因在番鴨毛囊、皮膚毛囊、心、肝、脾、肺、腎、骨骼肌、卵巢(♀)、睪丸(♂)、下丘腦、垂體、腎上腺、尾脂腺、脂肪等共15個(gè)組織的表達(dá)量。發(fā)現(xiàn)ASIP基因在禽類皮膚組織(毛囊和皮膚)和中樞神經(jīng)系統(tǒng)(下丘腦)及其他非皮膚中均有表達(dá)。AGRP基因與ASIP基因一樣,在番鴨各組織均存在表達(dá),其中AGRP基因在下丘腦和腎上腺中表達(dá)量較高。利用方差分析
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