煙草脈帶花葉病毒、蕪菁花葉病毒和馬鈴薯Y病毒的遺傳結(jié)構(gòu)分析.pdf

1、煙草脈帶花葉病毒（Tobacco vein banding mosaic virus，TVBMV）、馬鈴薯Y病毒（Potato virus Y，PVY）和蕪菁花葉病毒（Turnip mosaic virus，TuMV）都屬于馬鈴薯Y病毒屬（Potyvirus）。TVBMV和PVY是煙草上的重要病毒，在我國煙草上的危害呈上升趨勢；TuMV是十字花科植物上的重要病毒。它們侵染作物后造成作物產(chǎn)量和品質(zhì)的下降。本研究分別分析了TVBMV、TuM

2、V和PVY三種病毒的群體結(jié)構(gòu)。
　　 從中國煙草主產(chǎn)區(qū)采集到40個TVBMV分離物，測定了其HC-Pro、P3、6K1和CP基因，通過比較GenBank上其它分離物的相應(yīng)序列分析了TVBMV的遺傳多樣性和種群結(jié)構(gòu)。根據(jù)不同基因的分析結(jié)果，將TVBMV分離物劃分為兩個（6K1和CP）或三個組（P3和HC-Pro）。中國云南分離物單獨成簇，基因交流頻繁，但與其它省份分離物之間的基因交流不頻繁。TVBMV的4個基因片段都處于負向選擇，

3、但不同的基因片段承受的選擇壓力不同。分析的42個分離物中有13個發(fā)生重組。
　　 通過RT-PCR擴增得到中國的56個TuMV蘿卜分離物的3'-末端基因組序列，分析其群體變異。中國105個分離物（含GenBank上49個）中，共有12個分離物存在明顯重組。系統(tǒng)進化樹結(jié)果表明，中國TuMV可分為Asian-BR、basal-BR和world-B三個組，有50.5％的分離物位于basal-BR組中。中國basal-BR組分為3個亞組

4、，Ⅰ和Ⅱ亞組與日本的basal-BRⅠ、Ⅱ亞組一致，但是Ⅲ亞組單獨成簇，日本還存在Ⅳ亞組。濰坊和泰安的basal-BR分離物是新出現(xiàn)的譜系，處于爆發(fā)狀態(tài)。TuMV每個組或亞組都處于負向（純化）選擇。泰安和濰坊地區(qū)的分離物基因交流頻繁。
　　 從中國煙草主要種植區(qū)采集PVY分離物，接種到莧色藜（Chenopodiumamaranticolor）上，經(jīng)過多次單斑分離獲得25個生物純的分離物。測定了這25個分離物的HC-Pro和CP序

5、列及另外4個分離物的CP序列。25個分離物中有22個能引起煙草葉脈壞死，3個引起煙草花葉或脈明。19個分離物用PVYo CP單克隆抗體檢測呈現(xiàn)陽性反應(yīng)。血清學(xué)和分子進化分析表明，25個分離物中有3個為O株系、2個為N株系、2個為NTN株系、16個為N-Wi株系和2個為N-HcO株系。Feixian8和Mengyin60屬于N-HcO株系，他們具有類似PVYo株系的HC-Pro與類似PVYN株系CP基因，但是能引起煙草葉脈壞死，為新的株系

6、。HC-Pro和CP編碼區(qū)處于負向選擇，但是HC-Pro序列的7個氨基酸和CP序列的6個氨基酸處于正向選擇。PVY的亞種群不具有寄主特異性，不同亞種群承受的選擇壓力不同。
　　 馬鈴薯X病毒（Potato virus X，PVX）是常見的植物病毒之一，主要侵染茄科植物。本研究測得了一株1985年的PVX分離物（PVX-1985）的全基因組序列。PVX-1985不包括Poly（A）尾巴共6435個核苷酸（nucleotides，n