腸球菌肽脫甲?;竝df基因的分離與酶活性研究及以PDF為靶點的高通量新藥篩選模型的建立與應用.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、本研究采用生物信息學方法將已知大腸桿菌、肺炎鏈球菌的PDF氨基酸序列與NCBI Gene bank中部分測序的腸球菌(Enterococcus faecium)基因組進行BLAST比較,獲得腸球菌PDF同源序列.在該同源序列中含有其他微生物PDF酶活性必須的三個保守基序:Motif1{GXGXAAXQ}、Motif2{EGCLS}和Motif3{HEXDH}.通過基因序列比對分析,確定腸球菌中PDF同源序列的開放閱讀框(open rea

2、ding frame,ORF),用PCR擴增出該開放閱讀框并進行測序分析.該擴增的腸球菌PDF同源序列與原核蛋白表達載體pET-30-a(+)連接后,轉化蛋白表達宿主大腸桿菌BL21(DE3),IPTG誘導表達.純化誘導表達蛋白,使純度達到90%以上.腸球菌PDF酶活性分析包括:酶與甲?;牡孜颋or-Met-Val-Ser相互作用的動力學特點,以及溫度、pH對酶活力的影響.通過酶活性研究與Western blot分析證實了所獲得的腸

3、球菌PDF同源序列即為腸球菌的肽脫甲?;富?并將首次分離得到的腸球菌pdf登入NCBI Gene bank(Gene bank Accession number AY238515).以純化的腸球菌PDF為靶點,首次建立了體外篩選其拮抗劑的分子高通量篩選模型,并用此模型篩選了近10,000個樣品,其中化合物樣品為2,000個,微生物發(fā)酵液樣品為8,000個.在近10,000樣品中,獲得10個抑酶陽性樣品,其中微生物發(fā)酵液樣品8個,化合

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