桿狀病毒介導(dǎo)的噬菌體Lambda-Red樣重組及其應(yīng)用.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、λ-噬菌體Red重組是由λRed操縱子三個基因(Redα、β、γ)編碼的蛋白酶所介導(dǎo)的同源重組,通常這種重組發(fā)生在大腸桿菌細(xì)胞中線性DNA與環(huán)狀DNA分子之間。外切核酸酶α消化DNA片段的5’端產(chǎn)生突出的3’端單鏈,該單鏈結(jié)合Redβ后可單鏈間互補退火(線-線重組),或者侵入雙鏈中同源區(qū)退火(線-環(huán)重組),最后由細(xì)胞內(nèi)的DNA修復(fù)機制完成重組,從而實現(xiàn)基因敲除或替換。
  桿狀病毒的堿性核酸酶AN和單鏈DNA結(jié)合蛋白LEF-3分別

2、是噬菌體λRedα外切酶和β重組酶(或者原噬菌體RecE/T)的同源物,具有各自相應(yīng)的蛋白酶活性。我們根據(jù)前期的研究推測桿狀病毒可能利用AN和LEF-3介導(dǎo)Red重組。為此我們構(gòu)建了一個可線性化的復(fù)制缺陷型病毒載體BmBacmid-KO1629-CAT-(BmBAC-KO1629-CAT-),通過線性化該載體與具有0-50 bp同源臂的GFP PCR產(chǎn)物共轉(zhuǎn)染BmN細(xì)胞,產(chǎn)生重組病毒,表明桿狀病毒的確能介導(dǎo)線-線Red樣重組。
 

3、 進一步研究發(fā)現(xiàn),桿狀病毒的線-線Red樣重組涉及到非同源的末端連接。我們通過線性化的BmBAC-KO1629-CAT--RFP與含有相同50bp右同源臂不同左臂的GFP PCR產(chǎn)物共轉(zhuǎn)染BmN細(xì)胞,產(chǎn)生一系列重組病毒證實桿狀病毒線-線Red樣重組存在非同源的末端連接。
  基于桿狀病毒Red樣重組的特性,我們設(shè)計了一種重組桿狀病毒無縫克隆的方法,利用重疊PCR合成含有必需同源臂的目的基因片段,然后直接與線性化的BmBAC-KO1

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