FAT10基因遺傳變異與肝細(xì)胞癌發(fā)生發(fā)展的關(guān)聯(lián)性研究.pdf

1、目的：研究FAT10基因外顯子和側(cè)翼序列單核苷酸多態(tài)性(single-nucleotidepolymorphism，SNP)與肝細(xì)胞癌發(fā)生和臨床病理的關(guān)系。
　　 方法：收集254例肝癌病例和268例健康對照人群外周血標(biāo)本，提取DNA，通過DNA直接測序分析方法，檢測兩組人群FAT10基因外顯子和側(cè)翼序列單核苷酸多態(tài)性。應(yīng)用Haploview統(tǒng)計(jì)軟件分析研究對象的連鎖不平衡和單體型，并應(yīng)用病例對照分析方法進(jìn)行相關(guān)性研究。

2、　　 結(jié)果：在病例組和對照組共檢測到10個(gè)SNPs。依據(jù)測序數(shù)據(jù)和遺傳不平衡分析選擇3個(gè)tagSNPs(-143 A/G、+3476T/C和+3527T/C)進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析和單體型構(gòu)建，發(fā)現(xiàn)-143A/G和+3476 T/C基因型與相應(yīng)的野生型純合子相比明顯降低肝癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(OR=0.38，95％CI：0.22-0.66和OR=0.34，95％CI：0.21-0.56，p<0.05)，但這些多態(tài)性位點(diǎn)的基因型型頻率與肝癌的臨床表型無關(guān)

3、(p>0.05)。另外單體型分析發(fā)現(xiàn)ATT、ATC、GCT和ACT四種單體型，其中肝癌組GCT和ACT單體型頻率顯著低于對照組(OR=0.41，95％CI=0.24-0.70和OR=0.43，95％CI=0.22-0.98，p<0.05)，而ATT單體型頻率顯著高于對照組(OR=1.64，95％CI=1.24-2.17，p<0.05)，經(jīng)過1×108的隨機(jī)置換檢驗(yàn)校正后，ATT和GCT單體型與肝癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)仍然顯著相關(guān)(p<0.05)。