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文檔簡介
1、本論文研究內(nèi)容是水牛SRY基因和胚胎性別鑒定PCR體系的建立和優(yōu)化。論文共分為兩部分:第一部分,包括第一章和第二章,為文獻綜述部分;第二部分,包括第三章和第四章,為試驗研究部分。 第三章研究目的是通過對水牛SRY基因的克隆、序列分析及Southern雜交檢測,為進一步研究SRY基因的作用機理和設(shè)計特異于水牛SRY基因的胚胎性別鑒定引物打下基礎(chǔ)。根據(jù)荷斯坦牛SRY基因設(shè)計一對引物,PCR擴增后得到水牛SRY基因,測序后分析表明,該
2、基因長度為2005bp,其中1~504bp為5’啟動子區(qū)(Promoter),1196~2005bp為3’側(cè)翼序列(UTR),505~1195bp為SRY的讀碼框(ORF)。將該基因序列提交到GenBank數(shù)據(jù)庫(登錄號為DQ417872)。BLAST比對顯示,與牛屬動物的同源性為95﹪~96﹪,其中HMG-box區(qū)的同源性高達99﹪,具有高度的進化保守性。使用ClustalX對水牛SRY基因外顯子區(qū)域做多重比對分析后,構(gòu)建部分哺乳動物
3、系統(tǒng)進化樹,與實際進化關(guān)系保持很好的一致。在SRY基因保守區(qū)設(shè)計探針,分別對雄性水牛和雌性水牛基因組進行Southern雜交,只在雄性水牛出現(xiàn)雜交信號,說明SRY基因為雄性特異。 第四章研究目的是建立并優(yōu)化水牛胚胎性別鑒定的PCR體系,以便該項技術(shù)能在生產(chǎn)中大規(guī)模應(yīng)用。根據(jù)第三章中水牛SRY基因核心序列設(shè)計兩對特異于水牛的性別鑒定引物SA1/SA2、SB1/SB2,根據(jù)小鼠ZFX/ZFY基因和水牛G3PDH基因分別設(shè)計內(nèi)參引物Z
4、A1/ZA2、GA1/GA2。對不同哺乳動物的DNA進行特異性檢測和梯度濃度的公水牛DNA進行敏感性檢測以篩選出最佳引物。分別使用煮沸法、蛋白酶K+Tween20法、Tween20+DTT法裂解胚胎樣品,擴增雌雄共有的G3PDH基因,比較擴增結(jié)果篩選出最佳的胚胎裂解方法。結(jié)果顯示,1)引物SB1/SB2、GA1/GA2擴增結(jié)果較好,分別作為檢測引物和內(nèi)參引物;2)三種處理方法的有效檢出率分別為85.3﹪(29/34)、97.1﹪(33/
5、34)和97.1﹪(33/34),后兩種處理方法的擴增效率高于煮沸法,為簡化操作,選取DTT+Tween20法。 對篩選出的引物SB1/SB2和GA1/GA2設(shè)計一對巢式引物SB3/SB4、GA3/GA4,建立多重巢式PCR體系,對不同Mg2+濃度、不同dNTPs濃度、不同引物濃度比例和不同循環(huán)數(shù)進行多次試驗以優(yōu)化多重巢式PCR反應(yīng)體系。采用以上優(yōu)化后PCR反應(yīng)體系,對27枚水牛桑椹胚和24枚Y精子受精的IVF胚胎進行性別鑒定,
6、并使用斑點雜交方法驗證PCR擴增準確率,結(jié)果顯示,1)多重巢式PCR體系中,Mg2+濃度為1.5mM,dNTPs濃度為100μM;引物SB3/SB4、GB3/GB4濃度分別為0.5μM、0.25μM時擴增效果較好,循環(huán)數(shù)以35為宜;2)27枚水牛桑椹胚可鑒定率為100﹪,雄性比例為51.9﹪(14/27),雌性比例為48.1﹪(13/27)。斑點雜交結(jié)果表明擴增準確率為100﹪;3)Y精子受精胚胎鑒定結(jié)果中雄性比例為83.3﹪(20/2
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