胃癌組織中MicroRNa-200a的表達及靶基因預測.pdf

1、目的:胃癌是源于胃粘膜上皮的惡性腫瘤，發(fā)病率及死亡率均很高。中國是胃癌高發(fā)的國家，發(fā)病率及死亡率均高于世界平均水平。雖然目前采取了包括手術、放療、化療及生物治療等綜合性治療，但治療的效果仍不十分理想，五年總生存低下。胃癌的發(fā)生有多種癌基因及抑癌基因的參與，揭示這些基因的變化規(guī)律，有助于闡明胃癌的發(fā)病機制，還能協(xié)助腫瘤的治療及預后。隨著近幾年對胃癌研究的深入，人們逐漸意識到胃癌發(fā)生的機制比想象的更加復雜。微小RNA(microRNA，mi

2、RNA)是一類內(nèi)源性的長約21-25nt的非編碼單鏈RNA。研究發(fā)現(xiàn)，細胞的所有生物學過程幾乎都有miRNA參與，包括細胞的發(fā)育、增殖、凋亡等。miRNA在腫瘤的發(fā)生發(fā)展中可能發(fā)揮著致癌或抑癌的作用。目前miRNA與腫瘤的關系逐漸受到重視，但其與胃癌的關系尚不明確。本研究通過Real-timePCR技術檢測miRNA-200a在胃癌患者的癌組織及癌旁正常組織中的表達情況，探討其表達情況與臨床病理因素間的相關性。并利用生物信息學方法探索m

3、iRNA-200a的相關靶基因。從而為闡明miR-200a在胃癌發(fā)生及發(fā)展中的作用機制提供理論依據(jù)。
　　 方法:
　　 1收集2011年3月至6月于我院外科手術的，27例胃癌組織標本及癌旁正常組織標本。運用定量Real-timePCR方法檢測miRNA-200a在胃癌組織及癌旁正常胃組織中的表達情況。采用配對t檢驗分析miRNA-200a的表達在胃癌組織癌旁組織中的差異。
　　 2收集標本的臨床病理資料，包括性

4、別、年齡、腫瘤大小、浸潤深度、TNM分期、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、Borrmann分型和組織學分化程度等，然后采用單因素方差分析的統(tǒng)計學方法分析miRNA-200a在胃癌組織中的表達水平與胃癌臨床病理特征間的相關性。
　　 3應用生物信息學軟件PicTar、MiRanda和TargetScan對miRNA-200a的靶基因進行預測，篩選共同的靶基因。基于GeneOntology數(shù)據(jù)庫，對共同的靶基因進行GO分類，并對其進行顯著性篩選，進一步

5、縮小靶基因的范圍。
　　 結(jié)果:
　　 1Real-timePCR技術檢測27對胃癌及其癌旁正常組織miRNA-200a的相對表達量，結(jié)果顯示22例(81％)miRNA-200a在癌組織中的表達水平顯著低于癌旁正常組織，5例(29％)高于癌旁正常組織。在胃癌組織中相對表達量RQ值為0.33-0.01，對應癌旁正常組織為0.78±0.15，結(jié)果顯示miRNA-200a在胃癌組織中表達顯著下調(diào)，有統(tǒng)計學意義（P＜0.05）。

6、
　　 2miRNA-200a的表達水平與脈管瘤栓存在相關性（P＜0.05）。與性別、年齡、腫瘤大小、浸潤深度、TNM分期、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、Borrmann分型和組織學分化程度等各臨床病理參數(shù)間均無顯著相關性(P＞0.05）。
　　 3運用生物信息學軟件PicTar、MiRanda和TargetScan分析，預選出miRNA-200a靶基因的數(shù)目分別為430個、7645個和363個。發(fā)現(xiàn)交集靶基因共38個，包括KHDRBS2

7、、GNB1、HMGB1、NOVA1、PAFAH1B1、PELI1等。基于GeneOntology數(shù)據(jù)庫，對共同的靶基因進行GO分類，并對其進行顯著性篩選，提示部分靶基因參與信號的轉(zhuǎn)導、蛋白質(zhì)磷酸化、細胞增殖、遷移、凋亡等生物學過程。
　　 結(jié)論:
　　 1MiRNA-200a在胃癌組織中表達呈顯著下調(diào)，顯著低于癌旁正常組織中的表達。
　　 2MiRNA-200a的表達與脈管瘤栓存在相關性。提示miRNA-200a