利用基因芯片及磁分離技術(shù)對蘇北地區(qū)胃癌單核苷酸多態(tài)性易感性研究.pdf

1、我國的胃癌發(fā)病率和死亡率均居各類腫瘤之首，是世界上胃癌發(fā)病率和死亡率最高的國家之一。胃癌的發(fā)生是遺傳和環(huán)境因素共同作用的結(jié)果，個體遺傳特性決定對腫瘤的易感性，早發(fā)現(xiàn)是改善療效、提高胃癌患者生存率的關(guān)鍵。因此，深入進行胃癌病因?qū)W和發(fā)病機制研究，尋找和確定相關(guān)分子標(biāo)志物和易感因素，篩選高危人群以采取有效的預(yù)防控制和治療措施具有重要意義。SNP是人類基因組中最常見的變異，具有數(shù)量多、分布廣、易于快速檢測、便于分型等特點。根據(jù)“常見疾病，常見變

2、異”理論，在胃癌病例人群和正常對照人群中進行SNP分型對比研究，可以確定SNP位點或其鄰近變異與腫瘤發(fā)病風(fēng)險的關(guān)系，從而可應(yīng)用于腫瘤遺傳易感性的研究。
　　本文在前人研究的基礎(chǔ)上，首先制備了γ-Fe2O3磁性納米粒子，并修飾親和素，同時對研究樣本進行DNA提取，擴增出含有待檢測SNP位點的PCR產(chǎn)物，然后利用基于磁性納米粒子和雙色熒光雜交的SNP分型方法對大量樣本進行分型。該方法充分將雙色熒光探針雜交技術(shù)、生物芯片的高通量“并行”

3、讀出技術(shù)、以及磁性納米粒子易于實現(xiàn)分離、富集的功能相結(jié)合，實現(xiàn)了對大量樣本的低成本、高效率、高準(zhǔn)確性分型。利用此方法對蘇北地區(qū)人群118個胃癌病例和120個正常對照的COX-2基因啟動子區(qū)-765G>C多態(tài)位點和BCL-2基因-938C>A多態(tài)位點進行SNP分型，最后采用SPSS13.0進行統(tǒng)計分析，應(yīng)用X2檢驗和非條件Logistic回歸模型計算OR(odds ratio)和95％CI(Confidenceinterval)對分型結(jié)果

4、進行病例.對照研究，得到如下結(jié)論：
　　1、在胃癌病例組和正常對照組中COX-2基因-765G>C位點和BCL-2基因-938C>A位點的基因型頻率分布均符合Hardy-Weinberg遺傳平衡定律，選取樣本具有群體代表性，可以代表蘇北地區(qū)人群。
　　2、與COX-2基因-765GG型比較，帶有COX-2基因-765GC+CC基因型的個體在胃癌組中顯著增高，OR值為1.808(95％CI：1.050～3.113，P=0.03

5、3)，即個體攜帶-765GC或CC基因型能顯著增高胃癌的發(fā)病風(fēng)險，C等位基因與蘇北地區(qū)人群胃癌易感性增高相關(guān)。
　　3、單獨攜帶BCL-2-938CC基因型的個體患胃癌的風(fēng)險是攜帶AA基因型個體的3.185倍，這表明在同等外在條件下，攜帶CC基因型的個體更容易患胃癌，且隨著C等位基因的增加，OR值上升趨勢明顯，提示BCL-2基因-938C>A位點的多態(tài)性與胃癌的遺傳易感性呈等位基因計量-效應(yīng)關(guān)系。
　　4、深入研究表明：CO

6、X=2-765CC和COX-2-765GC分別與BCL-2-938CC基因型在胃癌的發(fā)病風(fēng)險中存在著明顯的加乘交互效應(yīng)，與COX-2-765GG和BCL-2-938AA基因型攜帶者相比，其胃癌的發(fā)病風(fēng)險明顯增高，OR值分別為10(95％CI：1.280～78.117，P=0.028<0.05)和4.667(95％CI：1.137～19.154，P=0.0325<0.05)，統(tǒng)計學(xué)差異顯著，說明COX-2基因和BCL-2基因在胃癌的發(fā)生中