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文檔簡介
1、豬流行性腹瀉(Porcine epidemic diarrhea,PED)是由冠狀病毒屬豬流行性腹瀉病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)引起的豬的一種以腹瀉、嘔吐和脫水為主要臨床特征的高度接觸性傳染病。豬流行性腹瀉無論是流行病學(xué)特性、臨床癥狀還是小腸的病理變化都與豬傳染性胃腸炎(TGE)和豬輪狀(PR)十分相似,單憑臨床經(jīng)驗和組織病變只能初步診斷。目前,還沒有有效的檢測方法區(qū)分這三種病毒。近年
2、來又由于豬腹瀉頻繁爆發(fā)、得不到有效控制,已給世界養(yǎng)豬業(yè)造成了巨大的經(jīng)濟損失。因此,建立優(yōu)化快速、準(zhǔn)確、簡便的檢測方法對于PEDV分子生物學(xué)研究及臨床防制都有重要意義。
研究建立了PEDV檢測的RT-PCR以及熒光定量PCR方法;PEDV抗體檢測的IFA方法和相對定量中和試驗方法。
PEDV檢測的RT-PCR:本實驗根據(jù)GenBank已登錄的PEDV-ORF3基因,利用Primer5.0軟件設(shè)計合成一對特異性引
3、物,并進行條件優(yōu)化,擴增PEDV-ORF3全長基因,將片段與載體pMD18-T連接并轉(zhuǎn)化至TOP10感受態(tài)細胞,大量提取質(zhì)粒,測序并分析。建立的RT-PCR方法,通過優(yōu)化退火溫度,確定了最佳反應(yīng)體系和擴增程序,退火溫度確定在52-55℃,敏感性實驗結(jié)果檢測到初始模板中1.86pg的RNA;特異性實驗中TGEV、PRV、PRRSV、HEV及陰性對照均為陰性。臨床樣品檢測陽性率達80%。
PEDV檢測熒光定量PCR方法:根據(jù)G
4、enBank已登錄的PEDV M基因,利用Primer5.0軟件設(shè)計合成一對特異性引物,RT-PCR擴增出特異性目的片段,目的片段與載體pMD18-T連接并轉(zhuǎn)化至TOP10感受態(tài)細胞,大量提取質(zhì)粒,酶切鑒定。重組質(zhì)粒測濃度并根據(jù)公式計算拷貝數(shù)。梯度稀釋質(zhì)粒制備標(biāo)準(zhǔn)品,建立PEDV標(biāo)準(zhǔn)曲線且線性關(guān)系良好,R2=0.997,建立PEDV-M熒光定量PCR方法,并通過優(yōu)化條件,確定反應(yīng)程序和體系。敏感性實驗可檢測到3.168copies/μL
5、的模板cDNA。特異性實驗中TGEV、PRV、PRRSV、HEV陰性對照均為陰性,陽性樣則出現(xiàn)目的條帶。重復(fù)性試驗中,批內(nèi)重復(fù)和批間重復(fù)其變異系數(shù)都小于2%。臨床樣品檢測結(jié)果陽性率達98%。
PEDV抗體檢測的IFA方法:將適應(yīng)于PEDV體外培養(yǎng)的LR7細胞鋪于24孔板,24h后,按MOI=0.1鋪上病毒,于37℃病毒吸附1h,棄去病毒液,24-36h后加入一抗和二抗,并設(shè)陰性血清對照、無一抗的病毒對照和正常細胞對照,熒光
6、顯微鏡下觀察。以建立免疫熒光方法。結(jié)果:可在顯微鏡下觀察到特異的熒光,且陰性血清對照、無一抗的病毒對照和正常細胞對照均無特異性熒光出現(xiàn)。
PEDV抗體檢測的相對定量中和試驗方法:將不同稀釋度的陽性血清與插入GFP發(fā)光基團的PEDV病毒37℃中和30min,鋪于長滿VERO細胞的24孔板,12h后熒光顯微鏡下觀察,用細胞裂解液將細胞裂解下來后用TBS-380微型熒光計測的熒光值,建立線性關(guān)系,建立微量中和實驗相對定量血清抗體
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