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1、從湖羊瘤胃Fosmid文庫的12,704個克隆中,通過剛果紅染色分析獲得16個具有內(nèi)切葡聚糖酶活性的陽性克隆。根據(jù)陽性克隆透明圈大小從中選取兩個(HF105和HF126)克隆進行序列測定。序列測定結(jié)果表明,HF105中含有1個編碼內(nèi)切葡聚糖酶的ORF,編碼359個氨基酸,該蛋白含有一個糖基水解酶家族5(GH5)的結(jié)構(gòu)域(pfam00150)。該結(jié)構(gòu)域與Butyrivibrio crossotus DSM2876的內(nèi)切葡聚糖酶同源性最高,
2、氨基酸序列相似性為72%。HF126中含有1個編碼內(nèi)切葡聚糖酶的ORF,編碼759個氨基酸,該蛋白含有三個結(jié)構(gòu)域,分別為CBM_4_9(pfam02018),CelD-N(pfam02927)和GH9(pfam00759)。其中GH9結(jié)構(gòu)域與Butyrivibrio fibrisolvens16/4的GH9基因序列(CBK74409.1)同源性最高,氨基酸序列相似性為85%。
分別將內(nèi)切葡聚糖酶基因HFec105和HFec
3、126與原核表達(dá)載體pET-30a(+)相連接,導(dǎo)入E.coli BL21(DE3)構(gòu)建基因工程菌。分別經(jīng)1mM IPTG誘導(dǎo)表達(dá)5h和10h后,菌體破碎離心取上清,點樣于羧甲基纖維素鈉平板,39℃培養(yǎng)3h,經(jīng)剛果紅染色,在平板上可見明顯的透明圈,表明表達(dá)產(chǎn)物EHFec105以及EHFec126都具有羧甲基纖維素酶活性;進一步用SDS-PAGE和Western blot進行分析檢測,EHFec105蛋白分子量約為45kDa與推導(dǎo)的融合蛋
4、白分子量一致,EHFec126蛋白分子量在95-130kDa之間,比推到的融合蛋白分子量89kDa稍大。
破碎上清液經(jīng)6×His親和層析純化,分析純化酶HFec105和HFec126對于不同底物的水解活性。結(jié)果顯示,HFec105對CMC底物和β-葡聚糖底物的比活性分別為7.21U/mg和3.89U/mg,最適反應(yīng)溫度為50℃,最適pH為6.0;HFec126對CMC底物和β-葡聚糖底物的比活性分別為3.76U/mg和23
5、.39U/mg,最適反應(yīng)溫度為40℃,最適pH為6.0;而兩者對p-NPG、微晶纖維素以及木聚糖均沒有水解作用。
將HFec105基因的成熟肽序列與pGAPZαA載體相連接,電擊轉(zhuǎn)化畢赤酵母GS115構(gòu)建重組酵母工程菌GS115-pGAPZαA-HFec105。在YPD培養(yǎng)基中30℃連續(xù)發(fā)酵120h,分別收集48,72,96和120h表達(dá)上清點樣于羧甲基纖維素鈉平板,39℃培養(yǎng)3h,經(jīng)剛果紅染色,平板上可見明顯的透明圈,表
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