XRCC2基因SNPs多態(tài)性與結(jié)直腸癌關(guān)系的研究.pdf

1、 目的：通過檢測XRCC2基因C41657T G4234C單核苷酸多態(tài)性在結(jié)直腸癌(Colorectal Cancer,CRC)患者及正常對照者中的基因型及等位基因頻率的分布,研究XRCC2基因C41657T G4234C SNPs與CRC易感性的關(guān)系,以及與CRC患者臨床病理學(xué)參數(shù)之間的相關(guān)性；探討C41657T多態(tài)性對XRCC2蛋白在CRC組織和正常組織中表達(dá)的影響。方法：采用病例-對照研究的方法,病例組為246例漢族結(jié)直腸癌患者

2、, 對照組為同期體檢健康者262例,抽取外周靜脈血2ml,同時調(diào)查其個人資料、病史及臨床病理學(xué)參數(shù)。使用酚-氯仿-異戊醇法提取外周血基因組DNA,采用聚合酶鏈反應(yīng)-限制性片段長度多態(tài)性(polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism , PCR-RFLP)檢測XRCC2基因C41657T G4234C SNPs的基因型及等位基因的分布,連鎖不平衡與單體

3、型分析用SHEsis在線軟件進(jìn)行,比較結(jié)直腸癌患者C41657T位點(diǎn)各基因型與腫瘤臨床病理參數(shù)之間的關(guān)系。收集病例組結(jié)直腸癌腫瘤組織50例和正常大腸組織36例,免疫組織化學(xué)(Immunohistochemistry,IHC)技術(shù)檢測腫瘤組織及正常組織中XRCC2蛋白的表達(dá),卡方檢驗(yàn)分析蛋白表達(dá)的差異。C41657T和G4234C各基因型與結(jié)直腸癌的患病風(fēng)險(xiǎn)采用logistic回歸分析,計(jì)算相對危險(xiǎn)度比值比(odds ratio,OR)和

4、95%可信區(qū)間(95%confidence interval,95%CI)。采用SPSS11.5軟件包進(jìn)行統(tǒng)計(jì),以P<0.05為有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。結(jié)果：(1)結(jié)直腸癌患者和對照組在性別、年齡、吸煙史、飲酒量無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異；XRCC2基因C41657T及G4234C位點(diǎn)基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。(2)XRCC2基因C41657T位點(diǎn)CC、CT、TT各個基因型在病例組和對照組中的頻率分別為63.4%、33.3

5、%、3.3%和74.0%、23.3%、2.7%,兩組間的基因型頻率分布不同,差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)；C、T等位基因在病例組和對照組的基因頻率分別為80.1%、19.9%和85.7%、14.3%,兩組間比較有顯著性差異(P<0.05)。XRCC2基因G4134C位點(diǎn)GG、GC、CC各基因型在病例組和對照組中的頻率分別為67.5%、30.1%、2.4%和72.9%、24.8%、2.3%,兩組間的基因型頻率分布無明顯統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P

6、>0.05)；G、C等位基因在病例組和對照組的基因頻率分別為82.5%、17.5%和85.3%、14.7%,兩組間比較無顯著性差異(P>0.05)。(3)XRCC2基因 C41657T SNP與結(jié)直腸癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)：與CC基因型相比,CT合并TT基因型顯著增加結(jié)直腸癌的患病風(fēng)險(xiǎn)(OR=1.646,95%CI=1.127~2.404),而C等位基因?yàn)閭€體患結(jié)直腸癌的保護(hù)性因素。XRCC2基因 C41657T SNP與結(jié)直腸癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)無

7、關(guān)：與GG基因型相比, GC合并CC基因型不能增加結(jié)直腸癌的患病風(fēng)險(xiǎn)(OR=1.296,95%CI=0.885~1.898)。(4)應(yīng)用SHEsis在線軟件對XRCC2 基因C41657T和G4234C 兩個SNP位點(diǎn)進(jìn)行連鎖不平衡及單體型分析顯示, XRCC2 SNP間存在連鎖不平衡現(xiàn)象( D'=0.184, r2=0.032 , P=1.62e-8 )。XRCC2的4種單體型的分布在結(jié)直腸癌患者與正常對照組間具有顯著性差異(χ2=1

8、1.189 , P=0.011 )。其中最常見的為41657C/4234G單體型, 41657T/4234G單體型在結(jié)直腸癌組的分布頻率為7.3%,顯著高于正常對照組的3.1%(χ2=10.236,P=0.002)。用非條件Logistic回歸法分析顯示,攜帶41657T/4234G單體型明顯增加了結(jié)直腸癌的患病風(fēng)險(xiǎn)( OR=2.601 , 95%CI=1.421~4.758)。(5)結(jié)直腸癌患者中XRCC2基因C41657T位點(diǎn)的各基

9、因型頻率在腫瘤的組織學(xué)類型(腺癌、粘液腺癌)中的分布具有顯著性差異(χ2=6.546,P=0.038),XRCC2基因C41657T位點(diǎn)的各基因型頻率的分布與腫瘤的部位、大體類型、分化程度、浸潤深度以及淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移等臨床病理學(xué)參數(shù)間無明顯差異(P>0.05)。(6)XRCC2基因C41657T位點(diǎn)多態(tài)性與其蛋白表達(dá)相關(guān)性顯示：XRCC2蛋白在結(jié)直腸癌組織中的表達(dá)率為64.00%,與正常組織中的表達(dá)率30.56%相比,具有顯著性差異(P=0

10、.02)。同時,XRCC2蛋白表達(dá)在結(jié)直腸癌組織及正常對照組中的表達(dá)率也未見明顯統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(χ2=0.230,P=0.631和χ2=0.536,P=0.708)。結(jié)論：(1) XRCC2基因C41657T多態(tài)性與結(jié)直腸癌的患病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān),CT合并TT基因型能顯著增加結(jié)直腸癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)；C等位基因是患結(jié)直腸癌的保護(hù)性因素。XRCC2基因G4234C多態(tài)性位點(diǎn)各基因型及等位基因頻率在結(jié)直腸癌病例組和正常對照組中總體分布差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,與結(jié)直

11、腸癌患病風(fēng)險(xiǎn)無相關(guān)性。(2) XRCC2基因C41657T多態(tài)性位點(diǎn)和G4234C多態(tài)性位點(diǎn)存在連鎖不平衡；41657C/4234G單體型最常見,與41657C/4234G單體型相比, 41657T/4234G單體型明顯增加了結(jié)直腸癌的患病風(fēng)險(xiǎn)。(3) XRCC2基因C41657T多態(tài)性位點(diǎn)與結(jié)直腸癌的腫瘤發(fā)生部位、分化程度、浸潤深度及有無淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移和直腸癌組織學(xué)類型等臨床病理學(xué)參數(shù)之間無相關(guān)性。(4) XRCC2蛋白的表達(dá)在結(jié)直腸癌標(biāo)