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1、目的:本研究通過(guò)病例-對(duì)照研究的方法,試討論XRCC6基因rs5751129和rs2267437兩個(gè)位點(diǎn)的單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide ploymorphisms SNP)與結(jié)直腸癌(Colorectal Cancer CRC)發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的相關(guān)性,為CRC高危人群的篩檢及診治提供有利的分子生物學(xué)依據(jù)。
方法:選取2012年2月-2013年2月間就診于河北醫(yī)科大學(xué)第四醫(yī)院的78例直腸癌患者,51例結(jié)腸癌患
2、者和74例健康人群做病例-對(duì)照研究。對(duì)符合實(shí)驗(yàn)條件的對(duì)象采集靜脈血5ml,并記錄年齡、性別、吸煙、飲酒、家族史等信息。采用蛋白酶K消化-飽和氯化鈉鹽析法提取研究對(duì)象白細(xì)胞中的DNA,采用聚合酶鏈反應(yīng)-連接酶檢測(cè)反應(yīng)(Polymerase Chain Reaction-ligase detection reaction,PCR-LDR)方法對(duì)XRCC6基因的rs2267437C/G和rs5751129C/T兩個(gè)SNP位點(diǎn)等位基因及基因分型
3、進(jìn)行檢測(cè)。
應(yīng)用SPSS13.0軟件(SPSS Company, Chicago,Illinois,USA)對(duì)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。采用x2檢驗(yàn)及t檢驗(yàn)對(duì)性別、抽煙、飲酒、腫瘤家族史及年齡加以分析,以P=0.05為檢驗(yàn)水準(zhǔn),P<0.05有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。采用x2對(duì)對(duì)照組基因型頻率進(jìn)行Hardy-Weinberg平衡分析。采用x2檢驗(yàn)對(duì)實(shí)驗(yàn)組與對(duì)照組之間的基因型和等位基因型分布加以分析比較。單體型頻率和連鎖不平衡分析采用EH軟件
4、和2LD軟件(1.2 version,Rockefeller University, New York)。應(yīng)用非條件Logistic回歸法計(jì)算表示相對(duì)風(fēng)險(xiǎn)度的比值比(odds ratio,OR)及95%可信區(qū)間(confidence interval,CI)。
結(jié)果:
1、對(duì)照組中-1310 rs2267437C/G和T-991 Crs5751129C/T兩個(gè)位點(diǎn)的基因型頻率分布都符合Hardy-Weinbe
5、rg平衡(P>0.05)。
2、XRCC6基因rs5751129C/T多態(tài)性與CRC發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)性分析:XRCC6基因rs5751129C/T位點(diǎn)上等位基因C和T在結(jié)腸癌組中出現(xiàn)頻率為96.1%和3.9%,直腸癌組中出現(xiàn)頻率為92.9%和7.1%,在對(duì)照組中為94.6%和5.4%,兩組分別相比,認(rèn)為結(jié)腸癌和對(duì)照組,直腸癌和對(duì)照組的差異均沒(méi)有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P分別為0.553和0.812)。在結(jié)腸癌組中T/T、C/T兩種基因型出
6、現(xiàn)的頻率分別92.2%和7.8%,直腸癌組中T/T、C/T兩種基因型出現(xiàn)的頻率分別85.9%和14.1%,而在正常對(duì)照組中分別為89.2%和10.8%,兩組分別與對(duì)照組相比較,差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P分別為0.841和0.852)。攜帶T/T基因型和C/T基因型與結(jié)腸癌和直腸癌的發(fā)生無(wú)相關(guān)性(OR=0.876,95%CI=0.239-3.214;OR=1.111,95% CI=0.368-3.353)。
3、XRCC6基因r
7、s2267437C/G多態(tài)性與CRC發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的相關(guān)性分析:XRCC6基因rs2267437C/G位點(diǎn)上等位基因C和G在結(jié)腸癌組中出現(xiàn)頻率為78.4%和21.6%,在直腸癌組中出現(xiàn)頻率為76.9%和23.1%,在正常對(duì)照組中為87.2%和12.8%,表明在直腸癌與對(duì)照組的對(duì)比中,差別有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.02);在結(jié)腸癌與對(duì)照組的對(duì)比中差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.67)。在結(jié)腸癌中C/C、C/G兩種基因型出現(xiàn)的頻率分別為56.9%和43.1
8、%,在直腸癌中分別為53.8%和46.2%,而在正常對(duì)照組中則為74.3%和25.7%,結(jié)腸癌組和直腸癌組分別與對(duì)照組對(duì)比較,差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.041, OR=2.196,95%CI=1.026-4.700;P=0.009, OR=2.481,95%CI=1.250-4.926)。
4、采用EH軟件和2LD軟件對(duì)結(jié)腸癌組和對(duì)照組中XRCC6基因rs2267437C/G和rs5751129C/T兩SNPs位點(diǎn)進(jìn)行聯(lián)
9、合分析。顯示(Table5)XRCC6基因rs2267437C/G與rs5751129C/T兩位點(diǎn)間存在連鎖的不平衡現(xiàn)象(D'=0.994)。人群中rs5751129T-rs2267437C單體型(OR=1.250,95%CI=1.052~2.075), rs5751129T-rs2267437G單體型(OR=0.846,95%CI=0.506~0.914),表明此兩種基因型與結(jié)腸癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)存在關(guān)聯(lián)性。其它兩種單體型的OR值和95%CI
10、分別為0.406(95%CI=0.009~18.820)、0.716(95%CI=0.209~2.449),表明此兩種單體型可能與結(jié)腸癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)無(wú)關(guān)。
對(duì)直腸癌組和對(duì)照組中XRCC6基因rs2267437C/G和rs5751129C/T兩位點(diǎn)SNPs聯(lián)合分析,顯示(Table6)XRCC6基因rs2267437C/G與rs5751129C/T兩位點(diǎn)間存在連鎖的不平衡現(xiàn)象(D'=0.993)。四種單體型的OR值和95%CI
11、分別為0.598(95%CI=0.653~1.605)、1.331(95%CI=0.519~3.413),1.024(95%CI=0.653~1.605)、0.913(95%CI=0.579~1.439),表明此四種單體型可能與直腸癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)無(wú)相關(guān)性。
結(jié)論:
1、XRCC6基因T-991C(rs5751129) SNP可能與CRC的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)無(wú)相關(guān)性。
2、XRCC6基因-1310(rs226
12、7437) SNP與CRC的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)存在相關(guān)性。攜帶C/G基因型可能會(huì)增加CRC發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)。G等位基因可能是河北及其周邊地區(qū)人群CRC發(fā)病的一個(gè)基因易感性標(biāo)志。
3、結(jié)腸癌組和對(duì)照組中XRCC6基因rs5751129與-rs2267437SNPs位點(diǎn)間存在連鎖不平衡(D'=0.994)。rs5751129T-rs2267437C單體型增加結(jié)腸癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn),而rs5751129T-rs2267437G單體型降低結(jié)腸癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)。
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