MKK4基因啟動(dòng)子區(qū)多態(tài)性與結(jié)直腸癌發(fā)病的關(guān)聯(lián)研究.pdf_第1頁(yè)
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1、目的:通過(guò)病例-對(duì)照研究法試討論絲裂原活化蛋白激酶激4(mitogen-activated protein kinase kinase4,MKK4)基因rs3826392和rs3809728兩位點(diǎn)的單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide ploymorphisms,SNP)與結(jié)直腸癌(Colorectal Cancer CRC)發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)關(guān)聯(lián)性,為CRC高危人群的篩選和早期診斷提供理論依據(jù)。
  方法:提取2012年2月

2、-2013年2月間就診于河北醫(yī)科大學(xué)第四醫(yī)院211例CRC患者(結(jié)腸癌68例,直腸癌143例)和132例健康人(對(duì)照組)外周靜脈血5ml,采用蛋白酶K消化—飽和氯化鈉鹽析法提取研究對(duì)象白細(xì)胞中的DNA,同時(shí)記錄病例的一般人口學(xué)特征、吸煙史、飲酒史及癌癥家族史等信息。應(yīng)用聚合酶鏈反應(yīng)-連接酶特異檢測(cè)技術(shù)(Polymerase ChainReaction-ligase detection reaction,PCR-LDR)分析CRC患者和對(duì)

3、照組MKK4基因rs3826392T/G和rs3809728A/T位點(diǎn)多態(tài)性,比較不同等位基因及基因分型與CRC易感性的關(guān)系。
  應(yīng)用SPSS13.0軟件對(duì)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)處理,采用x2對(duì)對(duì)照組基因型頻率進(jìn)行Hardy-Weinberg平衡分析,采用x2檢驗(yàn)及t檢驗(yàn)對(duì)兩組病例的一般情況進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,采用x2檢驗(yàn)對(duì)兩組之間的基因型和等位基因型分布分別進(jìn)行比較分析,采用EH軟件和2LD軟件對(duì)兩組病例進(jìn)行單體型頻率和連鎖不平衡分析。P

4、<0.05為有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。應(yīng)用非條件Logistic回歸法計(jì)算表示相對(duì)風(fēng)險(xiǎn)度的比值比(odds ratio,OR)及95%可信區(qū)間(95%confidence interval, CI)。
  結(jié)果:
  1對(duì)照組中-1304T>G和-1044A>T兩個(gè)位點(diǎn)的基因型頻率分布都符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05),即本實(shí)驗(yàn)研究對(duì)象的選擇是隨機(jī)的。
  2 MKK4基因-1304T>G多態(tài)性與CRC發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)

5、的關(guān)聯(lián)性
  MKK4基因-1304T>G位點(diǎn)上等位基因T和G在結(jié)腸癌組中出現(xiàn)頻率為84.56和15.44%,直腸癌組中出現(xiàn)頻率為82.87%和17.13%,在對(duì)照組中為71.59%和28.41%,結(jié)腸癌組和直腸癌組分別與對(duì)照組相比,差異均具統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P為0.004和0.002)。與T相比G降低了結(jié)腸癌和直腸癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(OR=0.460,95%CI=0.269-0.787;OR=0.521,95%CI=0.347-0.783)

6、。結(jié)腸癌組中TT、TG、GG三種基因型出現(xiàn)的頻率分別72.06%、25.00%、2.94%,TG+GG出現(xiàn)頻率為27.94%;直腸癌組TT、TG、GG基因型出現(xiàn)頻率為67.83%、30.07%、2.10%,TG+GG為32.17%;對(duì)照組中為50.76%、41.67%,7.57%,TG+GG為49.24%;直腸癌組與對(duì)照組中TT基因型與TG、GG、TG+GG分別相比較,差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P分別為0.017、0.012、0.004);結(jié)

7、腸癌組與對(duì)照組中TT與TG、GG、TG+GG相比,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P為0.009、0.158、0.004)。攜帶TG基因型的個(gè)體及TG+GG基因型總體的直腸癌的發(fā)病率明顯降低(TGvsTT:OR=0.540,95%CI=0.326-0.896;GG vs TT: OR=0.207,95% CI=0.055-0.781;TG+GGvs TT: OR=0.489,95% CI=0.300-0.797)。
  3 MKK4基因-104

8、4A>T位點(diǎn)多態(tài)性與CRC發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)聯(lián)性
  MKK4基因1044A>T位點(diǎn)上等位基因A和T在結(jié)腸癌組、直腸癌組中出現(xiàn)頻率為73.53%、26.47%、74.13%和25.87%,正常對(duì)照組中為78.03%和21.97%,結(jié)腸癌組和直腸癌組與對(duì)照組相比,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P為0.145和0.284);與A相比T與結(jié)腸癌和直腸癌的發(fā)病無(wú)相關(guān)性(OR=1.421,95%CI=0.876-2.305; OR=1.240,95%CI=0

9、.836-1.838)。在結(jié)腸癌組中AA、AT、TT三種基因型出現(xiàn)的頻率為:54.41%、38.24%、7.35%,直腸癌組中為:54.55%、38.24%、7.35%,對(duì)照組中為:61.36%、33.33%、5.31%。結(jié)腸癌組與對(duì)照組中AA基因型與AT、TT、AT+TT分別相比較,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P為0.416、0.467、0.344);直腸癌組與對(duì)照組中AA與AT、TT、AT+TT分別相比較,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P為0.276、0

10、.583、0.253)。與AA基因型相比,攜帶AT、TT基因型的個(gè)體以及AT+TT基因型與結(jié)腸癌和直腸癌的發(fā)病率無(wú)相關(guān)性(ATvsAA: OR=1.564,95%CI=0.465-5.253;TTvsAA: OR=0.749,95% CI=0.266-2.110; AT+TT vs AA: OR=1.331,95% CI=0.736-2.405)。
  4 MKK4 rs3826392T/G和rs3809728A/T兩SNP s位

11、點(diǎn)聯(lián)合分析
  直腸癌組和對(duì)照組中MKK4基因rs3826392T/G與rs3809728A/T兩位點(diǎn)間存在連鎖不平衡現(xiàn)象(D'=0.213)。rs3826392T-rs3809728T單體型(OR=0.531,95%CI=0.119~0.723)與直腸癌發(fā)病存在相關(guān)性,其余單體型與直腸癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)無(wú)關(guān)聯(lián)性。rs3826392T/G與rs3809728A/T兩位點(diǎn)間存在連鎖不平衡現(xiàn)象(D'=0.993)。四種單體型與結(jié)腸癌的發(fā)病無(wú)

12、關(guān)聯(lián)性。
  結(jié)論:
  1 MKK4基因-1304T>G SNP與CRC的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)存在相關(guān)性。攜帶TG基因型的個(gè)體以及TG+GG基因型總體的CRC的發(fā)病率明顯降低;相比T等位基因G降低了CRC的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)。1044A>T SNP可能與CRC的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)無(wú)相關(guān)性。
  2在直腸癌和對(duì)照組中MKK4基因rs3826392T/G與rs3809728A/T兩位點(diǎn)間存在連鎖不平衡現(xiàn)象(D'=0.213)。rs3826392T-rs

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