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文檔簡(jiǎn)介
1、研究病毒準(zhǔn)種及其耐藥種群的動(dòng)態(tài)分布,是闡明病毒耐藥和病毒學(xué)突破發(fā)生、發(fā)展的關(guān)鍵所在。
本文主要從兩部分進(jìn)行研究:
一、未抗病毒治療的慢性乙型肝炎患者肝內(nèi)HBVcccDNA和血清HBVDNA逆轉(zhuǎn)錄酶(reverse transcriptase,RT)區(qū)準(zhǔn)種特性的比較分析;
二、慢性乙型肝炎患者治療前后肝內(nèi)HBV cccDNA耐藥相關(guān)位點(diǎn)變異的觀察。
第一部分未抗病毒治療的慢性乙型肝炎
2、患者肝內(nèi)HBV cccDNA和血清HBV DNA RT區(qū)準(zhǔn)種特性的比較分析
目的:
了解未經(jīng)核苷類(lèi)似物抗病毒治療的慢性乙型肝炎患者肝內(nèi)HBV cccDNA和血清HBV DNA RT區(qū)準(zhǔn)種的組成情況以及兩者之間的關(guān)系。
方法:
納入26例未經(jīng)核苷類(lèi)似物抗病毒治療的慢性乙型肝炎患者,留取其肝穿組織和血清,并分別抽提肝組織HBV tDNA和血清HBV DNA;先以不降解質(zhì)粒的ATP依賴(lài)D
3、NA酶(PSAD)酶切純化肝組織HBVtDNA,利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR法定量肝內(nèi)HBV cccDNA和血清HBV DNA,根據(jù)定量結(jié)果,以跨雙缺口引物行巢式聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)擴(kuò)增HBV cccDNA的RT區(qū),以非跨雙缺口引物行巢式PCR擴(kuò)增血清HBV DNA的RT區(qū);應(yīng)用瓊脂糖凝膠電泳回收目的片段,然后對(duì)目的片段進(jìn)行克隆,主要包括重組質(zhì)粒的構(gòu)建、小量制備、酶切鑒定,最后對(duì)目的片段進(jìn)行直接測(cè)序;根據(jù)測(cè)序結(jié)果,分析肝內(nèi)HBV cccDN
4、A和血清HBV DNA RT區(qū)準(zhǔn)種的組成并比較分析兩者間的關(guān)系。
結(jié)果:
肝內(nèi)HBV cccDNART區(qū)準(zhǔn)種數(shù)為4~22,血清HBV DNA RT區(qū)準(zhǔn)種數(shù)為3~20,肝內(nèi)HBV cccDNA RT區(qū)和血清HBV RT區(qū)兩者的準(zhǔn)種數(shù)差異尚無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p>0.05);肝內(nèi)HBV cccDNA和血清HBV DNA RT區(qū)優(yōu)勢(shì)準(zhǔn)種核苷酸序列部分(5/26例)一致,部分(21/26例)不一致;肝內(nèi)HBV cccDNA
5、和血清HBV DNA RT區(qū)準(zhǔn)種復(fù)雜度在核苷酸水平和氨基酸水平的差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p>0.05);肝內(nèi)HBV cccDNA和血清HBV DNA RT區(qū)準(zhǔn)種多樣性在核苷酸水平和氨基酸水平的差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(p>0.05)。
結(jié)論:
1、證實(shí)了肝內(nèi)HBV cccDNA準(zhǔn)種的存在。
2.在未經(jīng)抗病毒治療的慢性乙型肝炎患者肝內(nèi)HBV cccDNA和血清HBV DNA RT區(qū)準(zhǔn)種數(shù)量差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義;
6、肝內(nèi)HBV cccDNA和血清HBV DNA RT區(qū)優(yōu)勢(shì)準(zhǔn)種不完全一致;兩者準(zhǔn)種復(fù)雜度和多樣性之間差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
第二部分慢性乙型肝炎患者治療前后肝內(nèi)HBV cccDNA耐藥相關(guān)位點(diǎn)變異的觀察
目的:
了解慢性乙型肝炎患者肝內(nèi)HBV cccDNA耐藥相關(guān)位點(diǎn)自然變異的發(fā)生情況及抗病毒治療前后,肝內(nèi)HBV cccDNA耐藥相關(guān)變異位點(diǎn)野生型與變異型所占比例變化情況。
方法:
7、> 納入了13例間隔約12月先后兩次肝穿的慢性乙型肝炎患者,抽提冰凍肝組織獲得HBV DNA抽提液,通過(guò)酶切純化、熒光定量PCR法定量肝內(nèi)HBV cccDNA和血清HBV DNA;應(yīng)用PCR、巢式PCR和直接測(cè)序法檢測(cè)治療前后肝內(nèi)HBV cccDNA耐藥相關(guān)位點(diǎn)變異;對(duì)肝內(nèi)HBV cccDNA的RT區(qū)克隆測(cè)序分析。
結(jié)果:
發(fā)現(xiàn)3例(3/13)存在肝內(nèi)HBV cccDNA耐藥相關(guān)位點(diǎn)自然變異;發(fā)現(xiàn)1例(
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