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文檔簡介
1、目的:
應用多元統(tǒng)計和數(shù)據(jù)挖掘技術(shù),探討肺癌的穩(wěn)健影響因素及其交互作用;利用HapMap數(shù)據(jù)庫篩選標簽SNPs,構(gòu)建單體型,探討XRCC3基因多態(tài)性與肺癌的關(guān)聯(lián);采用Meta分析評價XRCC3 Thr241Met多態(tài)性與肺癌的關(guān)聯(lián),探討國內(nèi)外有關(guān)研究的異質(zhì)性。
方法:
1、采用病例對照研究設計,收集781例肺癌病例與等數(shù)的性別、年齡(±3歲)頻數(shù)匹配的對照,通過調(diào)查問卷獲取生活飲食習慣等信息。應
2、用Clementine、SPSS、S-PLUS,構(gòu)建決策樹及非條件logistic回歸模型,評價吸煙者與不吸煙者各自的肺癌影響因素,計算OR及其95%CI,分析影響因素間的相加交互作用。
2、應用分子流行病學研究方法,采集病例的外周血與對照的唾液和口腔細胞,提取DNA,以PCR-RFLP技術(shù)對XRCC3的SNPs分型。應用Haploview挑選標簽SNPs,LDA檢驗HWE與LD,SPSS分析最優(yōu)遺傳模型及單個SNP與肺癌
3、的關(guān)聯(lián),Haplo.stats、THESIAS、PHASE2.1推斷單體型頻率及其對肺癌的影響。
3、計算機檢索有關(guān)數(shù)據(jù)庫,獲取15篇文獻,提取其中的16個研究數(shù)據(jù)信息,結(jié)合本研究資料,依據(jù)NOS、HWE、匹配狀況將研究劃分等級,分別采用單變量和多變量方法選擇遺傳模型,應用Stata評價異質(zhì)性和發(fā)表偏倚、計算效應合并OR值及95%CI,Quanto與SPSS分析各研究的檢驗效能及分類間的差異。
結(jié)果:
4、 1、肺癌的危險因素:肺癌家族史(吸煙OR=15.94,95%CI:2.06~123.44;不吸煙OR=3.15,95%CI:1.16~8.57);吸煙包年(OR=4.51,95%CI:3.22~6.32);被動吸煙(輕度OR=2.63,95%CI:1.84~3.75;重度OR=6.25,95%CI:2.30~17.01);居住地污染(吸煙OR=2.26,95%CI:1.37~3.72;不吸煙OR=4.72,95%CI:1.05~
5、2.81)。
2、肺癌的保護因素:常吃水果(吸煙OR=0.69,95%CI:0.50~0.96;不吸煙OR=0.44,95%CI:0.32~0.62)。
3、吸煙與居住地污染、肺癌家族史存在交互作用。
4、XRCC3的rs861537 AG或AA攜帶者的肺癌風險較GG攜帶者高(OR=1.51,95%CI:1.19~1.92);攜帶1個rs1799794 G,肺癌風險降低(OR=0.81,95%C
6、I:0.69~0.95);rs861539多態(tài)性與肺癌無明顯關(guān)聯(lián)。
5、以單體型對CGG/CGG為參照,攜帶CGG/CAA、CAA/CAA、CAA/CGA均增加了肺癌風險(分別對應OR=1.60,95%CI:1.17~2.19;OR=2.08,95%CI:1.38~3.15;OR=1.66,95%CI:1.10~2.51)。
6、迄今為止,在有關(guān)rs861539與肺癌關(guān)聯(lián)的研究文獻中,歐美的研究存在廣泛的遺傳
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