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文檔簡介
1、慢性腎臟疾病的發(fā)病率逐年增長,已成為醫(yī)學界的一大難題。中藥方劑對于解決疑難雜癥有很好的效果,但其作用機理尚不明確。網(wǎng)絡藥理學從分子角度研究藥物作用人體靶點的治病原理,而中藥具有多成分、多靶點的特色,使用網(wǎng)絡藥理學研究方劑能很好地解釋方劑的藥理機制,有助于輔助醫(yī)生進行決策。
本文以中藥成分作用機制為研究點,研究中藥成分作用的靶點蛋白和疾病來分析方劑在分子水平的藥理機制,輔助醫(yī)生進行決策。本文研究點主要包括作用關系預測、網(wǎng)絡分析和
2、藥理輔助決策平臺實現(xiàn)三個模塊,并使用C#進行服務端開發(fā),使用echarts等進行網(wǎng)絡和圖形的可視化。三個模塊的研究工作如下:
1.作用關系預測模塊包括成分和靶點以及成分和疾病的作用關系預測,統(tǒng)一視為成分和實體關系預測的分類問題。本文提出基于相似度的思想計算分類特征,使用化學指紋作為分子的指紋特征,使用分子指紋以及分子和實體的關系矩陣計算實體的指紋特征,使用8種相似度計算方法計算分子和實體的相似度作為分類模型特征,使用隨機森林算
3、法構(gòu)建模型。最后使用standard、pubchem和maccs指紋分別對酶、離子通道、G蛋白偶聯(lián)受體和核受體四個數(shù)據(jù)集構(gòu)建關系預測模型,使用五折交叉驗證來驗證模型的性能,三種分類模型的受試者工作特征曲線以下面積平均值分別達到99.51%、98.92%和97.66%。
2.網(wǎng)絡分析模塊包括對成分-靶點網(wǎng)絡、成分-疾病網(wǎng)絡的分析。為研究成分對于腎病的機理,構(gòu)建成分-腎靶點網(wǎng)絡和成分-腎病網(wǎng)絡;為研究成分在網(wǎng)絡上中的重要性對靶點和
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