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文檔簡介
1、目的:已有文獻報道丙型肝炎病毒(HCV)感染過程中CD8+T細胞免疫壓力可以導致病毒變異的出現(xiàn)。但是,這種免疫適應過程在群體水平上對于病毒進化的影響還不是很清楚。在本研究中我們利用44例慢性丙型肝炎患者研究病毒NS3 區(qū)的適應過程,初步篩查湖北地區(qū)HCV流行株中CD8表位的適應性變異情況。
方法:分離了69例HCV 感染患者體內(nèi)的病毒,以巢式PCR對HCV NS3 區(qū)進擴增并測序,同時對18條全長HCV NS3區(qū)的已知CD
2、8表位區(qū)內(nèi)部及外部的突變位點進行分析。此外,還分析了不同HLA-Ⅰ限制性免疫壓力作用下位點的變異情況。
結(jié)果:在已知CD8表位內(nèi)部的突變頻率明顯高于表位外部。我們通過對測序結(jié)果的比對分析發(fā)現(xiàn)在NS3 區(qū)的631個氨基酸中有7個(V1274I/T:95%;Y1444F:68%; T1636I:63%;S1148G:76%;L1382I:75%;S1560G:56%;A1647T:40%)突變頻率較高的氨基酸殘基。有意義的是,
3、7個氨基酸殘基中有5個(V1274I/T:95%;Y1444F:68%;T1636I:63%;S1148G:76%;L1382I:75%;)位于CD8表位內(nèi)部。群體水平上,HLA等位基因頻率較高的人群其相應的限制性CD8表位突變頻率相當高,這就提示群體水平上免疫壓力的重現(xiàn)性(即在擁有同種HLA等位基因的群體中,免疫壓力可以持續(xù)作用于該表位,促使該突變表位在群體中累積下來)。
結(jié)論:CD8+T細胞免疫壓力對丙型肝炎病毒進化有
4、重要的影響,HLA-Ⅰ相關(guān)的選擇性壓力是病毒NS3 進化的主要驅(qū)動力。群體水平上HCV 對CD8+T細胞免疫壓力的適應使疫苗的設計更加復雜化。
本課題的創(chuàng)新點:1.基于歐洲人群與中國人群HLA等位基因頻率不同,我們檢測中國人群中頻率較高的HLA等位基因相應限制性表位的變異情況,進一步分析CD8表位變異與HLA 多態(tài)性的相關(guān)性。2.國內(nèi)既往多項研究集中關(guān)注于HCV 變異與CTL表位關(guān)系的研究,僅少數(shù)關(guān)于HLA-I 類限制性等
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