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文檔簡介
1、肉質(zhì)性狀是畜禽生產(chǎn)中最重要的經(jīng)濟性狀之一,因而近年來對影響畜禽肉質(zhì)性狀基因的研究已成為動物分子遺傳育種工作的熱點。組織蛋白酶(cathepsin)家族屬于半胱氨酸蛋白酶類,它不僅能水解肌纖維中的蛋白,而且還能使動物的結(jié)締組織變松散,進而影響到肉的嫩度。在豬、牛和魚類的有關研究結(jié)果表明,組織蛋白酶基因家族成員可以作為影響畜禽的肉質(zhì)性狀候選基因,但在山羊方面卻未見有類似報道。
本研究運用RT-PCR結(jié)合克隆測序方法分別獲得了天府肉
2、羊CTSL基因、CTSH基因、CTSF基因的全編碼區(qū)序列。結(jié)果顯示,天府肉羊CTSL基因長1103bp包括有1005bp的開放閱讀框,編碼334個氨基酸,序列提交得到登錄號:KF953544.1。CTSL氨基酸存在信號肽,含有17個磷酸化位點,屬于親水性非跨膜蛋白。序列預測表明CTSL氨基酸序列含有兩個保守的結(jié)構域,即inhibitor_129結(jié)構域和Pept_C1結(jié)構域。氨基酸序列同源性分析顯示天府肉羊CTSL氨基酸序列和其它哺乳動物
3、之間有很高的相似性。氨基酸序列同源性分析和系統(tǒng)進化分析顯示天府肉羊CTSL與綿羊CTSL具有很近的遺傳關系。CTSL的二級結(jié)構以a螺旋和無歸卷曲為主。
天府肉羊CTSH基因長1043bp包括有1008bp的編碼區(qū),編碼335個氨基酸,序列提交得到登錄號:KJ650499。CTSH氨基酸存在信號肽,有11個磷酸化位點,屬于親水性非跨膜蛋白。CTSH也含有inhibitor129結(jié)構域和Pept_C1結(jié)構域。氨基酸序列同源性分析和
4、系統(tǒng)進化分析顯示天府肉羊CTSH和其它哺乳動物的CTSH有很近的遺傳關系。CTSH二級結(jié)構以a螺旋和無歸卷曲為主。
天府肉羊CTSF基因長1477bp包括有1383bp的編碼區(qū),編碼460個氨基酸,序列提交得到登錄號:KJ650498。它含有28個磷酸化位點,存在信號肽序列,屬于親水性非跨膜蛋白。氨基酸序列同源性分析和系統(tǒng)進化分析顯示天府肉羊CTSF與牛和綿羊的CTSF具有很近進化關系。CTSF二級結(jié)構以a螺旋和無歸卷曲為主。
5、
實時熒光定量分析了12月齡天府肉羊CTSL基因、CTSH基因和CTSF基因在心肌、肝臟、肺、腎臟、胸肌、腹殖肌、股二頭肌和膈肌等8個組織的相對表達情況,及其在1日齡、6月齡、12月齡和18月齡階段天府肉羊的肺和股二頭肌組織中相對表達的情況。結(jié)果顯示,CTSL基因、CTSH基因和CTSF基因在8個組織中都有表達,且都是在肺中的表達量最高。在肺中,3個基因的相對表達量都是隨年齡的增加而呈現(xiàn)先升高再降低的趨勢;在股二頭肌組織中,C
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