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文檔簡介
1、目的:選取5個急性髓系白血病(AML)相關基因,對新診斷的中國和歐洲血統(tǒng)占主要優(yōu)勢的西方AML患者進行基因突變差異比較。研究BCL11A在中國AML患者中的表達水平。對BCL11A上游調(diào)控機制進行深入研究,包括轉(zhuǎn)錄起始位點鑒定,啟動子活性分析,髓系分化關鍵調(diào)控因子CEBPα在BCL11A啟動子上結合位點的鑒定以及CEBPα對BCL11A的轉(zhuǎn)錄調(diào)控研究。進一步探討B(tài)CL11A在白血病發(fā)生過程中起到的致癌基因作用。
方法:⑴收集A
2、ML患者骨髓樣本269例,PCR擴增NF1,TP53,NRAS,F(xiàn)LT3,DNMT3A5個AML相關基因并進行測序鑒定,分析鑒定其突變情況。⑵TaqMan探針實時熒光定量方法,精確定量AML患者中BCL11A的表達水平,并與12例正常人骨髓樣本進行比較,分析其表達是否失調(diào)。⑶生物信息學分析及5'-RACE方法對BCL11A轉(zhuǎn)錄起始位點進行鑒定。⑷構建BCL11A啟動子及啟動子系列缺失體,通過雙熒光素酶報告基因系統(tǒng)分析啟動子活性。對活性顯
3、著的啟動子再次進行生物信息學分析,分析其可能的轉(zhuǎn)錄因子結合位點。⑸通過構建CEBPA相關表達載體,與BCL11A啟動子共轉(zhuǎn)染,CEBPA突變,啟動子結合位點突變等實驗鑒定CEBPα對BCL11A啟動子活性的影響。⑹通過過表達CEBPA實驗驗證其對內(nèi)源BCL11A表達的影響。⑺構建HL-60細胞分化模型,通過分化等實驗來研究ATRA誘導HL-60髓系分化過程中BCL11A所起的作用。
結果:①NF1,TP53,DNMT3A,NR
4、AS,F(xiàn)LT3在中國AML患者中的突變頻率分別為0,<1%,6%,7%,23%。且這5個基因突變與臨床特征包括年齡、性別、FAB-type和細胞遺傳學等沒有顯著的聯(lián)系。除FLT3-ITD外,其余四個基因在中國AML患者中的突變頻率均低于歐洲血統(tǒng)占主要優(yōu)勢的西方AML患者。②BCL11A在中國AML患者中表達失調(diào),表現(xiàn)出一定的高表達。③5'-RACE實驗發(fā)現(xiàn)BCL11A存在新轉(zhuǎn)錄起始位點,在NCBI公布的轉(zhuǎn)錄起始位點基礎上繼續(xù)向上游延伸1
5、42bp。④BCL11A新轉(zhuǎn)錄起始位點上游500bp堿基序列具有顯著的啟動子活性。⑤轉(zhuǎn)錄因子CEBPα抑制BCL11A啟動子活性,且抑制作用隨著CEBPA表達時間的延長和表達量的增加而加深。CEBPA基因突變后,抑制作用消失。對BCL11A啟動子上CEBPα可能的結合位點進行定點突變后,BCL11A啟動子活性上升約40%。⑥CEBPA過表達抑制內(nèi)源BCL11A表達。⑦HL-60細胞分化過程中,CEBPA表達水平上升,BCL11A表達水平
6、降低,兩者呈現(xiàn)負相關。而過表達BCL11A則會抑制HL-60細胞分化。
結論:本研究發(fā)現(xiàn)與西方研究相比,AML發(fā)生密切相關的基因在中國AML患者中突變頻率普遍偏低,提示在中國AML的發(fā)生發(fā)展中可能有其他基因通過其他尚未被發(fā)現(xiàn)的機制起作用。首次發(fā)現(xiàn)BCL11A在中國AML患者中表達失調(diào)。并在隨后的BCL11A分子遺傳調(diào)控網(wǎng)絡研究中鑒定了新的BCL11A轉(zhuǎn)錄起始位點,還首次發(fā)現(xiàn)髓系分化過程中關鍵的調(diào)控因子CEBPα可能作為一個主要
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