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1、目的:分析和鑒定鼻咽癌轉(zhuǎn)移中線(xiàn)粒體蛋白質(zhì)組的改變,篩選與鼻咽癌轉(zhuǎn)移相關(guān)的線(xiàn)粒體蛋白質(zhì),為進(jìn)一步揭示它們參與鼻咽癌轉(zhuǎn)移的分子機(jī)制和找尋與鼻咽癌轉(zhuǎn)移相關(guān)的特異性分子標(biāo)志物提供基礎(chǔ)。
方法:分別從鼻咽癌5-8F和6-10B細(xì)胞中分離線(xiàn)粒體,鑒定其純度,提取線(xiàn)粒體蛋白質(zhì)。經(jīng)2D-DIGE技術(shù)找出兩種細(xì)胞的線(xiàn)粒體差異蛋白質(zhì),進(jìn)行MALDI-TOF和ESI-Q-TOF質(zhì)譜分析,查詢(xún)數(shù)據(jù)庫(kù)鑒定。同時(shí)采用生物信息學(xué)方法對(duì)線(xiàn)粒體差異蛋白質(zhì)進(jìn)行G
2、O功能富集分析和蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建。并對(duì)鼻咽癌5-8F細(xì)胞中表達(dá)上調(diào)的部分線(xiàn)粒體差異蛋白質(zhì)進(jìn)行siRNA瞬時(shí)干擾,Transwell遷移實(shí)驗(yàn)觀察細(xì)胞運(yùn)動(dòng)能力的變化。
結(jié)果:包括PRDX3和SOD2在內(nèi)的16種線(xiàn)粒體差異蛋白質(zhì)得到鑒定。在鼻咽癌5-8F細(xì)胞中抑制PRDX3的表達(dá)能夠提高細(xì)胞的運(yùn)動(dòng)能力。GO功能富集分析顯示生物學(xué)過(guò)程主要表現(xiàn)在細(xì)胞對(duì)活性氧應(yīng)答反應(yīng)、過(guò)氧化氫代謝過(guò)程、線(xiàn)粒體膜電勢(shì)調(diào)控、細(xì)胞氧化還原動(dòng)態(tài)平衡和氧化還
3、原作用等5個(gè)方面;分子功能主要表現(xiàn)在氧化還原酶活性、半胱氨酸蛋白酶抑制劑活性、過(guò)氧化物酶活性、質(zhì)膜通道蛋白活性和抗氧化劑活性等5個(gè)方面。經(jīng)過(guò)數(shù)據(jù)挖掘,構(gòu)建了一個(gè)線(xiàn)粒體差異蛋白質(zhì)相互作用的網(wǎng)絡(luò)。結(jié)合腫瘤-間質(zhì)共演變假說(shuō)的觀點(diǎn)進(jìn)行分析,初步揭示了PRDX3、PRDX6、SOD2、ECH1、SERPINB5、COX5A、PDIA5、EIF5A、IDH3B和PSMC4等10種線(xiàn)粒體差異蛋白質(zhì)參與鼻咽癌轉(zhuǎn)移的可能分子機(jī)制,為氧化應(yīng)激直接促進(jìn)腫瘤轉(zhuǎn)
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